RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A0J9YYE9 177 aa16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 SPTLC1O15269 473 aa16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 CCNA2P20248 432 aa16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC18A2Q05940 514 aa16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 ANO7Q6IWH7 933 aa16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 LPGAT1Q92604 370 aa16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 MYLPFQ96A32 169 aa16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 NXNL1Q96CM4 212 aa16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 CDCA5Q96FF9 252 aa16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 PPP3R2Q96LZ3 170 aa16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 SPATA16Q9BXB7 569 aa16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 DTLQ9NZJ0 730 aa16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 PDZK1P1A8MUH7 402 aa16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 CBFA2T3O75081 653 aa16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 TRMUO75648 421 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 NELFEP18615 380 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 RXRGP48443 463 aa16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 MAPK11Q15759 364 aa16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 MAPKAPK3Q16644 382 aa16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 OR7A2PQ8NGA2 310 aa16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 TINF2Q9BSI4 451 aa16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 ENOPH1Q9UHY7 261 aa16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 HOXA2O43364 376 aa16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 METTL18O95568 372 aa16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC39A4Q6P5W5 647 aa16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 TXNDC11Q6PKC3 985 aa16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 AFTPHQ6ULP2 937 aa16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC185Q8N715 623 aa16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 OR2T34Q8NGX1 318 aa16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 OR2T3Q8NH03 318 aa16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 GPR88Q9GZN0 384 aa16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 SCN11AQ9UI33 1791 aa16.48■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 DDNO94850 711 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 TTPAP49638 278 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 MBTD1Q05BQ5 628 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 PTPRNQ16849 979 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 C6orf52Q5T4I8 152 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 SPESP1Q6UW49 350 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 MTFR1LQ9H019 292 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 PTTG2Q9NZH5 202 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 PRKAG3Q9UGI9 489 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 CKMP06732 381 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 MPP2Q14168 576 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 DPYSL2Q16555 572 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 EML3Q32P44 896 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 RHBDF2Q6PJF5 856 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 KIAA0408Q6ZU52 694 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 PANX3Q96QZ0 392 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 KLQ9UEF7 1012 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 CPA4Q9UI42 421 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 FADS3Q9Y5Q0 445 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 H3BMM5 538 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 ARIH2O95376 493 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 CYP2A7P20853 494 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 C1DQ13901 141 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 NECAB2Q7Z6G3 386 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 DEFB132Q7Z7B7 95 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM169Q96HH4 297 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 ADPRHL2Q9NX46 363 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 KCNU1A8MYU2 1149 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 TK2O00142 265 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC22A2O15244 555 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 UGT1A9O60656 530 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 CELF2O95319 508 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 ALDH2P05091 517 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 RPL9P32969 192 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 RALGDSQ12967 914 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 CDYL2Q8N8U2 506 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 FZD8Q9H461 694 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 REEP1Q9H902 201 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 UGT1A7Q9HAW7 530 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 UGT1A10Q9HAW8 530 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 UGT1A8Q9HAW9 530 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 IGSF9Q9P2J2 1179 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 SATB2Q9UPW6 733 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 TEX264Q9Y6I9 313 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 NUP188Q5SRE5 1749 aa16.47■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 FGF1P05230 155 aa16.46■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 DGKAP23743 735 aa16.46■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 PAX3P23760 479 aa16.46■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 EPHX2P34913 555 aa16.46■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 MAXP61244 160 aa16.46■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 TRAF3Q13114 568 aa16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms