RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394285.3

PDCL-202, Transcript of phosducin like, humanhuman

TSL 3

Gene PDCL, Length 595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL-202ENST00000394285 HDAC11Q96DB2 347 aa11.1□□□□□ -0.63
PDCL-202ENST00000394285 EXOC2Q96KP1 924 aa11.1□□□□□ -0.63
PDCL-202ENST00000394285 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PDCL-202ENST00000394285 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PDCL-202ENST00000394285 MGME1Q9BQP7 344 aa11.1□□□□□ -0.63
PDCL-202ENST00000394285 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
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PDCL-202ENST00000394285 DTLQ9NZJ0 730 aa11.1□□□□□ -0.63
PDCL-202ENST00000394285 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa11.1□□□□□ -0.63
PDCL-202ENST00000394285 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP11.1□□□□□ -0.63
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PDCL-202ENST00000394285 DOCK4Q8N1I0 1966 aa11.1□□□□□ -0.63
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PDCL-202ENST00000394285 FPGTO14772 594 aa11.09□□□□□ -0.63
PDCL-202ENST00000394285 PSTPIP1O43586 416 aa11.09□□□□□ -0.63
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PDCL-202ENST00000394285 TM7SF2O76062 418 aa11.09□□□□□ -0.63
PDCL-202ENST00000394285 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP11.09□□□□□ -0.63
PDCL-202ENST00000394285 PIGNO95427 931 aa11.09□□□□□ -0.63
PDCL-202ENST00000394285 THEGLP0DJG4 465 aa11.09□□□□□ -0.63
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PDCL-202ENST00000394285 GRK6P43250 576 aa11.09□□□□□ -0.63
PDCL-202ENST00000394285 MMP13P45452 471 aa11.09□□□□□ -0.63
PDCL-202ENST00000394285 RABIFP47224 123 aa11.09□□□□□ -0.63
PDCL-202ENST00000394285 NR2C2P49116 596 aa11.09□□□□□ -0.63
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PDCL-202ENST00000394285 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
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PDCL-202ENST00000394285 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
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PDCL-202ENST00000394285 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
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PDCL-202ENST00000394285 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa11.09□□□□□ -0.63
PDCL-202ENST00000394285 PPIL1Q9Y3C6 166 aa11.09□□□□□ -0.63
PDCL-202ENST00000394285 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa11.09□□□□□ -0.63
PDCL-202ENST00000394285 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
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PDCL-202ENST00000394285 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
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PDCL-202ENST00000394285 PCDH15Q96QU1 1955 aa11.07□□□□□ -0.64
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PDCL-202ENST00000394285 POM121BA6NF01 834 aa11.07□□□□□ -0.64
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PDCL-202ENST00000394285 TNFSF14O43557 240 aa11.07□□□□□ -0.64
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PDCL-202ENST00000394285 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
PDCL-202ENST00000394285 MMP12P39900 470 aa11.07□□□□□ -0.64
PDCL-202ENST00000394285 CDKN2BP42772 138 aa11.07□□□□□ -0.64
PDCL-202ENST00000394285 VAV2P52735 878 aa11.07□□□□□ -0.64
PDCL-202ENST00000394285 CLDN2P57739 230 aa11.07□□□□□ -0.64
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