RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 RPL9P32969 192 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 C6orf52Q5T4I8 152 aa18.38■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 BTBD8Q5XKL5 378 aa18.38■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 FAM156AQ8NDB6 213 aa18.38■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 RIN3Q8TB24 985 aa18.38■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 RTP3Q9BQQ7 232 aa18.38■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP18.38■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 APPL1Q9UKG1 709 aa18.38■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 PADI4Q9UM07 663 aa18.38■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 HEATR9A2RTY3 570 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 UBDO15205 165 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 RBP1P09455 135 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 BDNFP23560 247 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 EPHX2P34913 555 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 CHRNA4P43681 627 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 INHBCP55103 352 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 CDKL1Q00532 357 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 BIRC2Q13490 618 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 APOFQ13790 326 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 LRP8Q14114 963 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 REP15Q6BDI9 236 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 FAM171BQ6P995 826 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 CUZD1Q86UP6 607 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 GALNT4Q8N4A0 578 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 HMGCLL1Q8TB92 370 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 EME1Q96AY2 570 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 ACBD6Q9BR61 282 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 SPAG4Q9NPE6 437 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 PCDHGB4Q9UN71 923 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 FIS1Q9Y3D6 152 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 PTPRDP23468 1912 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 KLHL33A6NCF5 533 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 AURKAO14965 403 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 TRIM24O15164 1050 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 VILLO15195 856 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 HOXC8P31273 242 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 CCR1P32246 355 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 RPS6KA3P51812 740 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 C1QTNF8P60827 252 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 NADK2Q4G0N4 442 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 TIGD5Q53EQ6 642 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 IL23RQ5VWK5 629 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 AFMIDQ63HM1 303 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 LRRC49Q8IUZ0 686 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 SLC22A9Q8IVM8 553 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 DDI1Q8WTU0 396 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 OLFM1Q99784 485 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 SLC2A11Q9BYW1 496 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 SMOC2Q9H3U7 446 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 CYP4F12Q9HCS2 524 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 AP4S1Q9Y587 144 aa18.37■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 ARL5CA6NH57 179 aa18.36■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 CASTOR2A6NHX0 329 aa18.36■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 E7ENX8 843 aa18.36■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 RHDQ02161 417 aa18.36■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 SLC14A2Q15849 920 aa18.36■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 TAF2Q6P1X5 1199 aa18.36■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 METTL25Q8N6Q8 603 aa18.36■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 ATP6V1E2Q96A05 226 aa18.36■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 RANBP9Q96S59 729 aa18.36■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 TRMOQ9BU70 441 aa18.36■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 SLC25A23Q9BV35 468 aa18.36■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 ABCC13Q9NSE7 274 aa18.36■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 DMTF1Q9Y222 760 aa18.36■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 M0QZ92 97 aa18.35■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 FBP2O00757 339 aa18.35■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 KCNA5P22460 613 aa18.35■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 WNT3AP56704 352 aa18.35■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 GK3PQ14409 553 aa18.35■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 ACAP2Q15057 778 aa18.35■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 UPP1Q16831 310 aa18.35■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 MGAT5BQ3V5L5 792 aa18.35■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 AGKQ53H12 422 aa18.35■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF280DQ6N043 979 aa18.35■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa18.35■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 GALNT7Q86SF2 657 aa18.35■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 METTL23Q86XA0 190 aa18.35■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 GRIP2Q9C0E4 1043 aa18.35■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 ATXN3LQ9H3M9 355 aa18.35■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 ARNT2Q9HBZ2 717 aa18.35■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 MIOSQ9NXC5 875 aa18.35■□□□□ 0.53
SPNS3-201ENST00000355530 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms