RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000224820.1

Zkscan3-208, Transcript of Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, mousemouse

BASIC

Gene Zkscan3, Length 5,398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Pcdhb17Q91VD8 799 aa16■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Grhl1Q921D9 618 aa16■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 HaghlQ9DB32 283 aa16■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 IgtpQ9DCE9 423 aa16■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Bloc1s6Q9R0C0 172 aa16■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Gm5072A2AHM1 344 aa16■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Zfp277E9Q6D6 583 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Gm10801F7C7Q0 168 aa16■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Dusp8O09112 663 aa16■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Rfx2P48379 717 aa16■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Dnajc5P60904 198 aa16■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Cyp2j13Q3UNV4 503 aa16■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Ecm1Q61508 559 aa16■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Olfr385Q8VGT1 312 aa16■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5530400C23RikQ9D3I0 173 aa16■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Thap11Q9JJD0 305 aa16■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Mid2Q9QUS6 705 aa16■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Sf3b1Q99NB9 1304 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Gm12794L7MTS5 483 aa16■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Rrm2bQ6PEE3 351 aa16■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Ubash3bQ8BGG7 638 aa16■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Ubap1Q8BH48 502 aa16■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Adamts2Q8C9W3 1213 aa16■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Lrrc42Q8R2U7 421 aa16■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Map3k21Q8VDG6 1002 aa16■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Mrgpra2Q91WW4 305 aa16■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Pacsin3Q99JB8 424 aa16■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Rnf181Q9CY62 165 aa16■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 AuhQ9JLZ3 314 aa16■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Tnfrsf11aO35305 625 aa16■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Vps45P97390 570 aa16■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Etaa1Q5SVT3 877 aa16■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 OgdhQ60597 1023 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Ugt2a1Q80X89 528 aa16■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Atl1Q8BH66 558 aa16■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Dennd1cQ8CFK6 786 aa16■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Olfr704Q9EPF6 315 aa16■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Ikzf3O08900 507 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 AmacrO09174 381 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 PenkP22005 268 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Slc2a3P32037 493 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Vmn2r26Q6TAC4 855 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Olfr792Q7TRH9 311 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Wnt9aQ8R5M2 365 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Gpn3Q9D3W4 284 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Ribc2Q9D4Q1 309 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Efhd2Q9D8Y0 240 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 PgdQ9DCD0 483 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Prmt2Q9R144 448 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Sirpb1aA0A0A6YYP6 397 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Slc4a5E9Q3M5 1116 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Tmigd3G3X8R9 209 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Ptpn9O35239 593 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Kpna3O35344 521 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Cyp2b9P12790 491 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Snrpd1P62315 119 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Awat2Q6E1M8 333 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Nup107Q8BH74 926 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Man2a2Q8BRK9 1152 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 GcshQ91WK5 170 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Olfr703Q9EPF5 319 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Ptch2O35595 1182 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Rab21P35282 222 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Aarsd1Q3THG9 412 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Slc22a16Q497L8 649 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Tyw1Q8BJM7 721 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Zfp446Q8C9M8 523 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Prmt5Q8CIG8 637 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Rab14Q91V41 215 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Gm44G3UW88 330 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Vmn2r46L7N282 809 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Cyp2c38P56655 490 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 BtrcQ3ULA2 605 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Zbtb2Q3V3W4 514 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Scaf4Q6PFF0 1209 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Noc4lQ8BHY2 516 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Plac9Q8K262 108 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Rem2Q8VEL9 341 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Tpgs1Q99MS8 303 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Fam83dQ9D7I8 585 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Hsd3b7Q9EQC1 369 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Serpini2Q9JK88 405 aa15.99■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Gm3739L7N296 216 aa15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Pias1O88907 651 aa15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Kcnn4O89109 425 aa15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 LdhcP00342 332 aa15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Wnt3aP27467 352 aa15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 NadkP58058 439 aa15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Gja6Q6S5G4 283 aa15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Oscp1Q8BHW2 379 aa15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Epm2aip1Q8VEH5 606 aa15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Ndfip2Q91ZP6 311 aa15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 March2Q99M02 246 aa15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Anks3Q9CZK6 655 aa15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 4933425L06RikQ9D3Z8 585 aa15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Ifrd2Q9D8U0 441 aa15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Dcpp3L7N259 170 aa15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Ube2e3P52483 207 aa15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Lypla1P97823 230 aa15.98■□□□□ 0.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Olfml2bQ3V1G4 746 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 46.3 ms