Protein–RNA interactions for Protein: G3UW88

Gm44, MCG65130, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm44G3UW88 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Gm44G3UW88 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Gm44G3UW88 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Gm44G3UW88 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Gm44G3UW88 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Gm44G3UW88 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gm44G3UW88 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Gm44G3UW88 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Gm44G3UW88 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gm44G3UW88 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Gm44G3UW88 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gm44G3UW88 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gm44G3UW88 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gm44G3UW88 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gm44G3UW88 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Gm44G3UW88 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm44G3UW88 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Gm44G3UW88 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gm44G3UW88 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gm44G3UW88 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gm44G3UW88 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gm44G3UW88 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gm44G3UW88 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm44G3UW88 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gm44G3UW88 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gm44G3UW88 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm44G3UW88 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gm44G3UW88 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm44G3UW88 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm44G3UW88 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gm44G3UW88 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm44G3UW88 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gm44G3UW88 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gm44G3UW88 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm44G3UW88 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gm44G3UW88 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gm44G3UW88 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gm44G3UW88 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm44G3UW88 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Gm44G3UW88 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gm44G3UW88 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm44G3UW88 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Gm44G3UW88 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm44G3UW88 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm44G3UW88 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gm44G3UW88 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm44G3UW88 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gm44G3UW88 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm44G3UW88 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm44G3UW88 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm44G3UW88 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm44G3UW88 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm44G3UW88 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm44G3UW88 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm44G3UW88 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm44G3UW88 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm44G3UW88 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm44G3UW88 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm44G3UW88 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm44G3UW88 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm44G3UW88 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm44G3UW88 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm44G3UW88 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm44G3UW88 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gm44G3UW88 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm44G3UW88 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gm44G3UW88 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm44G3UW88 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm44G3UW88 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm44G3UW88 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm44G3UW88 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm44G3UW88 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm44G3UW88 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm44G3UW88 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gm44G3UW88 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm44G3UW88 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm44G3UW88 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm44G3UW88 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm44G3UW88 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm44G3UW88 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm44G3UW88 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm44G3UW88 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm44G3UW88 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm44G3UW88 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm44G3UW88 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm44G3UW88 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm44G3UW88 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm44G3UW88 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm44G3UW88 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm44G3UW88 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm44G3UW88 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm44G3UW88 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm44G3UW88 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm44G3UW88 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm44G3UW88 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm44G3UW88 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm44G3UW88 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm44G3UW88 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm44G3UW88 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm44G3UW88 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms