RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kank2Q8BX02 843 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 VcpkmtQ8C436 228 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tdrd7Q8K1H1 1086 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ClmpQ8R373 373 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pth2rQ91V95 546 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 B4galt3Q91YY2 395 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 OptcQ920A0 328 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PdgfdQ925I7 370 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Smim11aQ99J19 55 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp655Q9CZP3 541 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Clvs1Q9D4C9 354 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tnfaip8l2Q9D8Y7 184 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Syvn1Q9DBY1 612 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Il17rbQ9JIP3 499 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyb561d2Q9WUE3 222 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Racgap1Q9WVM1 628 aa6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Twf2Q9Z0P5 349 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ddx39bQ9Z1N5 428 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp384E9Q1A5 584 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr596F8VQ26 312 aa6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Srp72F8VQC1 671 aa6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 F830016B08RikG3UWE2 416 aa6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp2b19O55071 492 aa6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Aff2O55112 1272 aa6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tsta3P23591 321 aa6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Htr2cP34968 459 aa6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mc4rP56450 332 aa6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 St14P56677 855 aa6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lrig1P70193 1091 aa6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 BmxP97504 651 aa6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mtf2Q02395 593 aa6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc45a4Q0P5V9 785 aa6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nat9Q3UG98 241 aa6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc22a23Q3UHH2 689 aa6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfm4Q3UZZ4 505 aa6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cep295nlQ497N6 533 aa6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Armcx2Q6A058 784 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ssxb3Q6XAS4 170 aa6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sox11Q7M6Y2 395 aa6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cxcr1Q810W6 351 aa6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Msantd1Q8BIL2 278 aa6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 EmsyQ8BMB0 1264 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TpbglQ8C013 384 aa6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Stx5Q8K1E0 355 aa6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gspt1Q8R050 636 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 DdoQ922Z0 341 aa6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 HnrnpabQ99020 285 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 St7Q99M96 577 aa6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lrrc4Q99PH1 652 aa6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Raver1Q9CW46 748 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tomm70Q9CZW5 611 aa6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q9D4A5 307 aa6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q9D979 236 aa6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mettl7bQ9DD20 244 aa6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gprc5dQ9JIL6 344 aa6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Smpd3Q9JJY3 655 aa6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ap1m2Q9WVP1 423 aa6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Map2k5Q9WVS7 448 aa6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cldn3Q9Z0G9 219 aa6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Col11a1Q61245 1804 aa6.65□□□□□ -1.34
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam81bA0A140LI28 432 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr671A0A1B0GSN5 317 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc120A2AEV7 629 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r3A2AMT7 306 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1049A2ARZ0 308 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Skint6A7XUZ6 1240 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Celf5D3Z4T1 395 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp2w1E9Q816 493 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm10479K7N6H4 105 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mmp3P28862 477 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpc4P51655 557 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TankP70347 448 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AurkaP97477 395 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hbq1bQ3U0A6 142 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ceacam5Q3UKK2 947 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ankrd34bQ3UUF8 508 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fbxw11Q5SRY7 542 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arcn1Q5XJY5 511 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tfap2cQ61312 449 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lag3Q61790 521 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arhgap30Q640N3 1101 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Krt73Q6NXH9 539 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp512bQ6PHP4 879 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Scd4Q6T707 353 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rad9bQ6WBX7 403 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dnajc16Q80TN4 772 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pcid2Q8BFV2 399 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lair1Q8BG84 263 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem252Q8C353 183 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sik2Q8CFH6 931 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc47a1Q8K0H1 567 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rab15Q8K386 212 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r79Q8R285 306 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Exd2Q8VEG4 650 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zcchc14Q8VIG0 956 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Smim14Q91VT8 99 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Crtc3Q91X84 619 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Golm1Q91XA2 393 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sntg2Q925E0 539 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tnip2Q99JG7 430 aa6.65□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 50.1 ms