RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000018810.9

Cbx1-201, Transcript of Chromobox protein homolog 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cbx1, Length 1,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mill2Q8HWE5 355 aa18.39■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tasp1Q8R1G1 420 aa18.39■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zfp566Q8VCI1 386 aa18.39■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 RpainQ9CWY9 219 aa18.39■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Dnajb1Q9QYJ3 340 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Itpripl1A2ASA8 547 aa18.38■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zfp952B0V2W4 504 aa18.38■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Vmn2r10K7N621 847 aa18.38■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Vps4bP46467 444 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Prss55Q14BX2 321 aa18.38■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cog7Q3UM29 770 aa18.38■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Spa17Q62252 149 aa18.38■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hs3st2Q673U1 367 aa18.38■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Amer3Q6NS69 780 aa18.38■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Slc39a10Q6P5F6 833 aa18.38■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zfp759Q7M6X3 721 aa18.38■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zswim5Q80TC6 1188 aa18.38■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Bend7Q8BSV3 434 aa18.38■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Lrrc3bQ8VCH9 259 aa18.38■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tcaf2Q921K8 919 aa18.38■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hes6Q9JHE6 224 aa18.38■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kdelc1Q9JHP7 502 aa18.38■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 NagaQ9QWR8 415 aa18.38■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Copg2Q9QXK3 871 aa18.38■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ror1Q9Z139 937 aa18.38■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nlgn4lB0F2B4 945 aa18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 C2cd2E9Q3C1 696 aa18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cldn4O35054 210 aa18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Il3P01586 166 aa18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Icam1P13597 537 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Serpina6Q06770 397 aa18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fam47cQ14BE7 430 aa18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 CcnhQ61458 323 aa18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Phf8Q80TJ7 1023 aa18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Elp6Q8BK75 266 aa18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Spon2Q8BMS2 330 aa18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cpsf7Q8BTV2 471 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Dcun1d2Q8BZJ7 259 aa18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fem1cQ8CEF1 617 aa18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 GrpQ8R1I2 146 aa18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Dhcr24Q8VCH6 516 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zkscan3Q91VW9 553 aa18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ackr4Q924I3 350 aa18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 XpotQ9CRT8 963 aa18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fcf1Q9CTH6 198 aa18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 PdiltQ9DAN1 588 aa18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Lactbl1S4R213 581 aa18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm8257E9Q8R3 264 aa18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm7942L7N277 499 aa18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 F3P20352 294 aa18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pabpc1P29341 636 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ranbp1P34022 203 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ripply1Q2WG77 201 aa18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Garnl3Q3V0G7 1038 aa18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Foxj1Q61660 421 aa18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Arhgef18Q6P9R4 1021 aa18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Insig1Q8BGI3 259 aa18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nup93Q8BJ71 819 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fam221bQ8C627 487 aa18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Olfr846Q8VET8 312 aa18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Msi2Q920Q6 346 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zmynd10Q99ML0 440 aa18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rnf146Q9CZW6 359 aa18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 RhoaQ9QUI0 193 aa18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 PygmQ9WUB3 842 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Elf4Q9Z2U4 655 aa18.37■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Slc27a2O35488 620 aa18.36■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 C1qbpO35658 278 aa18.36■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cyp4a14O35728 507 aa18.36■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 mt-Co3P00416 261 aa18.36■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 PolP11369 1281 aa18.36■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zmym5Q3U2E2 627 aa18.36■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Adat2Q6P6J0 191 aa18.36■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 CherpQ8CGZ0 936 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Olfr615Q8VGY4 313 aa18.36■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 LiasQ99M04 373 aa18.36■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Coro7Q9D2V7 922 aa18.36■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tm9sf1Q9DBU0 606 aa18.36■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Krt7Q9DCV7 457 aa18.36■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 CtsrQ9JIA9 334 aa18.36■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Sept6Q9R1T4 434 aa18.36■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Olfr742A2RTP5 311 aa18.35■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm3259D3YUK0 475 aa18.35■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Serpinb6eI7HJI3 429 aa18.35■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Znf683I7HJS4 458 aa18.35■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 NmbrO54799 390 aa18.35■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Krt10P02535 570 aa18.35■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Spp1P10923 294 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 ItgavP43406 1044 aa18.35■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Scg3P47867 471 aa18.35■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fbxw18Q3TSA9 469 aa18.35■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fam72aQ8BFZ8 149 aa18.35■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Klhl38Q8BSF5 581 aa18.35■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Arhgap25Q8BYW1 648 aa18.35■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Znf668Q8K2R5 619 aa18.35■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Vps37cQ8R105 352 aa18.35■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Olfr371Q8VGB8 312 aa18.35■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ndufs1Q91VD9 727 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Serpina3nQ91WP6 418 aa18.35■□□□□ 0.53
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nrif1Q923B3 828 aa18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.3 ms