RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	CUL5	Q93034	780 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	MTMR8	Q96EF0	704 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	CPB2	Q96IY4	423 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	TTC14	Q96N46	770 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	KAT14	Q9H8E8	782 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	EDAR	Q9UNE0	448 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	KLRF2	D3W0D1	207 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	MEIS2	O14770	477 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	PCDHGA12	O60330	932 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	VPS4B	O75351	444 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	CDK4	P11802	303 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	OPRD1	P41143	372 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	BRCC3	P46736	316 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	SCAND1	P57086	179 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	HAND2	P61296	217 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	CDK17	Q00537	523 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	PPP3CA	Q08209	521 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	MGAT2	Q10469	447 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	TGIF1	Q15583	401 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	UBE2S	Q16763	222 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	SMC5	Q8IY18	1101 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	CMIP	Q8IY22	773 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	DRC7	Q8IY82	874 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	SNX19	Q92543	992 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	COQ10A	Q96MF6	247 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	MTMR9	Q96QG7	549 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	GPR174	Q9BXC1	333 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	VPS4A	Q9UN37	437 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	SATB2	Q9UPW6	733 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	ESPL1	Q14674	2120 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM150B	A6NC51	233 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	DRGX	A6NNA5	263 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	BTBD18	B2RXH4	712 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	CS	O75390	466 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	SOAT2	O75908	522 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	PRKD3	O94806	890 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	ENDOD1	O94919	500 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	DDAH2	O95865	285 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	HOXB2	P14652	356 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	TNFSF9	P41273	254 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	IFNAR2	P48551	515 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	PTTG1IP	P53801	180 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	TMPRSS15	P98073	1019 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	CYP4A11	Q02928	519 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	KDSR	Q06136	332 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	BFSP1	Q12934	665 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	PDGFRL	Q15198	375 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	DCAF6	Q58WW2	860 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	VPS53	Q5VIR6	699 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF410	Q86VK4	478 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	CNNM3	Q8NE01	707 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	RFFL	Q8WZ73	363 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	IGSF8	Q969P0	613 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	LURAP1	Q96LR2	239 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MLH1-223	ENST00000616768	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms