RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610404.4

TTR-204, Transcript of transthyretin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTR, Length 1,040 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-204ENST00000610404 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
TTR-204ENST00000610404 PMEPA1Q969W9 287 aa8.97□□□□□ -0.97
TTR-204ENST00000610404 ARRDC3Q96B67 414 aa8.97□□□□□ -0.97
TTR-204ENST00000610404 SLC46A1Q96NT5 459 aa8.97□□□□□ -0.97
TTR-204ENST00000610404 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
TTR-204ENST00000610404 ABCG4Q9H172 646 aa8.97□□□□□ -0.97
TTR-204ENST00000610404 KIAA1257Q9ULG3 409 aa8.97□□□□□ -0.97
TTR-204ENST00000610404 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
TTR-204ENST00000610404 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa8.97□□□□□ -0.97
TTR-204ENST00000610404 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa8.97□□□□□ -0.97
TTR-204ENST00000610404 OR51B4Q9Y5P0 310 aa8.97□□□□□ -0.97
TTR-204ENST00000610404 RP1P56715 2156 aa8.97□□□□□ -0.97
TTR-204ENST00000610404 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa8.97□□□□□ -0.97
TTR-204ENST00000610404 TCAF2A6NFQ2 919 aa8.96□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 CDRT15L2A8MXV6 281 aa8.96□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 F5H5T6 163 aa8.96□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 CETN3O15182 167 aa8.96□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 ALOX15BO15296 676 aa8.96□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 ZNF18P17022 549 aa8.96□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 AKT2P31751 481 aa8.96□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 GPD2P43304 727 aa8.96□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 RPL34P49207 117 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 NDUFA8P51970 172 aa8.96□□□□□ -0.98
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TTR-204ENST00000610404 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP8.96□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 NFATC3Q12968 1075 aa8.96□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 FGL2Q14314 439 aa8.96□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 CDKN3Q16667 212 aa8.96□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 ATL3Q6DD88 541 aa8.96□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 CRTC1Q6UUV9 634 aa8.96□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 Q6ZSR6 202 aa8.96□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa8.96□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 ATCAYQ86WG3 371 aa8.96□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 HORMAD1Q86X24 394 aa8.96□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 SH2D3CQ8N5H7 860 aa8.96□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 EXD3Q8N9H8 876 aa8.96□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 SLC35C1Q96A29 364 aa8.96□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 BTN2A3PQ96KV6 586 aa8.96□□□□□ -0.98
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TTR-204ENST00000610404 GPR27Q9NS67 375 aa8.96□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 DNAJC28Q9NX36 388 aa8.96□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 SLC25A13Q9UJS0 675 aa8.96□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 CFAP45Q9UL16 551 aa8.96□□□□□ -0.98
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TTR-204ENST00000610404 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa8.95□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
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TTR-204ENST00000610404 CPED1A4D0V7 1026 aa8.95□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 POM121BA6NF01 834 aa8.95□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 KCNU1A8MYU2 1149 aa8.95□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 K7ERQ8 282 aa8.95□□□□□ -0.98
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TTR-204ENST00000610404 NME1P15531 152 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 CHRNA3P32297 505 aa8.95□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 SYKP43405 635 aa8.95□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 CSRP3P50461 194 aa8.95□□□□□ -0.98
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TTR-204ENST00000610404 PDX1P52945 283 aa8.95□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 PMS1P54277 932 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP8.95□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 NFKB2Q00653 900 aa8.95□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 FZD2Q14332 565 aa8.95□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 STILQ15468 1287 aa8.95□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 TAF5Q15542 800 aa8.95□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa8.95□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 LINC00303Q3SY05 128 aa8.95□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 TPRG1LQ5T0D9 272 aa8.95□□□□□ -0.98
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TTR-204ENST00000610404 NEK5Q6P3R8 708 aa8.95□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 DENND1BQ6P3S1 775 aa8.95□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 CCDC81Q6ZN84 652 aa8.95□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 KRBA2Q6ZNG9 492 aa8.95□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 BEND5Q7L4P6 421 aa8.95□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa8.95□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 OR2A12Q8NGT7 310 aa8.95□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 GIMAP7Q8NHV1 300 aa8.95□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 BMFQ96LC9 184 aa8.95□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 PSMB7Q99436 277 aa8.95□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 DUSP23Q9BVJ7 150 aa8.95□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 ST7Q9NRC1 585 aa8.95□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 SEPT3Q9UH03 358 aa8.95□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 SOX13Q9UN79 622 aa8.95□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa8.95□□□□□ -0.98
TTR-204ENST00000610404 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
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