RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586541.5

PRKAR1A-212, Transcript of protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene PRKAR1A, Length 570 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1A-212ENST00000586541 C11orf70Q9BRQ4 267 aa5.76□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 HERPUD2Q9BSE4 406 aa5.76□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 SLC13A1Q9BZW2 595 aa5.76□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 TRIM7Q9C029 511 aa5.76□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 ADAM7Q9H2U9 754 aa5.76□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 IFT122Q9HBG6 1241 aa5.76□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 KLHL42Q9P2K6 505 aa5.76□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa5.76□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 GPR45Q9Y5Y3 372 aa5.76□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 STYXL1Q9Y6J8 313 aa5.76□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 C2orf16Q68DN1 1984 aa5.76□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 FRYLO94915 3013 aa5.76□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 DOCK8Q8NF50 2099 aa5.76□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 NRCAMQ92823 1304 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 PLXNA3P51805 1871 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 LRRIQ4A6NIV6 560 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 H3BNC9 293 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 ASAP2O43150 1006 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 THAP12O43422 761 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 NOBOXO60393 691 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 VNN1O95497 513 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 ACSL3O95573 720 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 OAS1P00973 400 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 RB1P06400 928 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 GSTA1P08263 222 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 TNNI1P19237 187 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 ACO1P21399 889 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 AGXTP21549 392 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 CHKAP35790 457 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 GJC1P36383 396 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 SLCO1A2P46721 670 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 ZNF132P52740 706 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 ITGA8P53708 1063 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 DEFB103AP81534 67 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 PPARDQ03181 441 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 CD69Q07108 199 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 ADAM15Q13444 863 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 SNX1Q13596 522 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 USP10Q14694 798 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 CNGA2Q16280 664 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 ZNF618Q5T7W0 954 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 IZUMO3Q5VZ72 239 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 SPOPLQ6IQ16 392 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 SWSAP1Q6NVH7 229 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 TAF2Q6P1X5 1199 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 KLHDC10Q6PID8 442 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 ABHD15Q6UXT9 468 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 CPLX4Q7Z7G2 160 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 TAX1BP1Q86VP1 789 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 BRSK2Q8IWQ3 736 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 RHOT1Q8IXI2 618 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 KATNAL2Q8IYT4 538 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 SYT8Q8NBV8 401 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 BBOF1Q8ND07 529 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 DEPTORQ8TB45 409 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 JADE3Q92613 823 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 SERPINB12Q96P63 405 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 GPR20Q99678 358 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 MSTO1Q9BUK6 570 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 IMPG2Q9BZV3 1241 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 LMAN2LQ9H0V9 348 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 RNPEPQ9H4A4 650 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 SLC40A1Q9NP59 571 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 ZNF302Q9NR11 478 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 HOMER3Q9NSC5 361 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 NINJ2Q9NZG7 142 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 LGALS13Q9UHV8 139 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 CITO14578 2027 aa5.75□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa5.74□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 ZNF292O60281 2723 aa5.74□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 TMEM120BA0PK00 339 aa5.74□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 VGLL3A8MV65 326 aa5.74□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 TP73O15350 636 aa5.74□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 NRP2O60462 931 aa5.74□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 TRIM13O60858 407 aa5.74□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 TCEA3O75764 348 aa5.74□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 LSM8O95777 96 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 LDHAP00338 332 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PRKAR1A-212ENST00000586541 LGALS2P05162 132 aa5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms