RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559557.1

MRPS11-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein S11, human

TSL 3

Gene MRPS11, Length 447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPS11-208	ENST00000559557	NEDD4	P46934	1319 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	USP34	Q70CQ2	3546 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	THAP12	O43422	761 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	TSPY3	P0CV98	308 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	TSPY8	P0CW00	308 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	MCC	P23508	829 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	COPB2	P35606	906 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	CDK7	P50613	346 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	STAT2	P52630	851 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	PGGT1B	P53609	377 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	OAZ1	P54368	228 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	ACVR2B	Q13705	512 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	CCDC174	Q6PII3	467 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	TLK2	Q86UE8	772 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	SESTD1	Q86VW0	696 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	TMEM199	Q8N511	208 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	P2RY11	Q96G91	374 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	TRIM2	Q9C040	744 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	IL25	Q9H293	177 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	ACAD9	Q9H845	621 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	VPS4A	Q9UN37	437 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	STX8	Q9UNK0	236 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	COG5	Q9UP83	839 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	ZMYM6	O95789	1325 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	MYO7A	Q13402	2215 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	COL4A6	Q14031	1691 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	PRSS44	E7EML9	344 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	PLA2G6	O60733	806 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	ZBED4	O75132	1171 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	NDUFB8	O95169	186 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	SCGB1D2	O95969	90 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	ZBED1	O96006	694 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	TIMP1	P01033	207 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	CD4	P01730	458 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	HRG	P04196	525 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	CSF2RA	P15509	400 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	ST6GAL1	P15907	406 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	MMP8	P22894	467 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	SLC16A2	P36021	539 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	SLC1A4	P43007	532 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	HAND2	P61296	217 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	PSMC6	P62333	389 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	GPS1	Q13098	491 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	ACOX1	Q15067	660 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	PELI3	Q8N2H9	469 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	IQCD	Q96DY2	449 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	CPVL	Q9H3G5	476 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	FZD3	Q9NPG1	666 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	PROCR	Q9UNN8	238 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	ELP1	O95163	1332 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	TSPY2	A6NKD2	308 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	UGDH	O60701	494 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	COQ9	O75208	318 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	ICAM1	P05362	532 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	PDHB	P11177	359 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	DRD1	P21728	446 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	HTR7	P34969	479 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	TNFAIP2	Q03169	654 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	BFSP2	Q13515	415 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	ALX1	Q15699	326 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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