RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 MT-CO1P00395 513 aa5.68□□□□□ -1.5
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CLSTN3-215ENST00000544584 UGT2B4P06133 528 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 PYGLP06737 847 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 ERCC2P18074 760 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 KELP23276 732 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 MAN1A1P33908 653 aa5.68□□□□□ -1.5
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CLSTN3-215ENST00000544584 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
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CLSTN3-215ENST00000544584 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP5.68□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 YPEL5P62699 121 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 COL28A1Q2UY09 1125 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 MARC1Q5VT66 337 aa5.68□□□□□ -1.5
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CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC70Q6NSX1 233 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 C19orf48Q6RUI8 117 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 SARM1Q6SZW1 724 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 AADATQ8N5Z0 425 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 RNF214Q8ND24 703 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 DEFB124Q8NES8 71 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM131CQ96AQ9 280 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 HMCESQ96FZ2 354 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 P2RY11Q96G91 374 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF670Q9BS34 389 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 SYT11Q9BT88 431 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 CALN1Q9BXU9 219 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC17A9Q9BYT1 436 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 TM6SF2Q9BZW4 377 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 THAP2Q9H0W7 228 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 TNKS2Q9H2K2 1166 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 SUV39H2Q9H5I1 410 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 ABHD10Q9NUJ1 306 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP5.68□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 TAS2R14Q9NYV8 317 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 FTSJ1Q9UET6 329 aa5.68□□□□□ -1.5
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CLSTN3-215ENST00000544584 MSRB2Q9Y3D2 182 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 CFAP46Q8IYW2 2715 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A087X0T9 212 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A1B0GTQ1 180 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM170AA1A519 330 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 ANTXRLA6NF34 631 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF487B1APH4 448 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM72CH0Y354 149 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 K7ERQ8 282 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 TK2O00142 265 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 GIPC1O14908 333 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC31A1O15431 190 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 MTSS1O43312 755 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 SPOPO43791 374 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 MFAP3LO75121 409 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 SOCS5O75159 536 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 ZMPSTE24O75844 475 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 TM7SF2O76062 418 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 PROSCO94903 275 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 GJB6O95452 261 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 IGHV4-34P06331 123 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 PTMAP06454 111 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM228BP0C875 321 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 THEGLP0DJG4 465 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 VAV1P15498 845 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 ACVRL1P37023 503 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 NOP2P46087 812 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 RXRGP48443 463 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 PEX5P50542 639 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 SCNN1BP51168 640 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 IRAK1P51617 712 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 EPHB1P54762 984 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 ARF5P84085 180 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 E2F1Q01094 437 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 ITKQ08881 620 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 ILKQ13418 452 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 TFDP2Q14188 446 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 LBRQ14739 615 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 PDK1Q15118 436 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 KIF19Q2TAC6 998 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 POM121L1PQ3SYA9 428 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM72AQ5TYM5 149 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 LRRC38Q5VT99 294 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 HGSNATQ68CP4 663 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM72DQ6L9T8 149 aa5.67□□□□□ -1.5
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