RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519254.2

CLN8-204, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-204ENST00000519254 FGF14Q92915 247 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 MRGPRX2Q96LB1 330 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 IL22Q9GZX6 179 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 SLC25A51Q9H1U9 297 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 NT5MQ9NPB1 228 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 OBP2AQ9NY56 170 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 SLC17A6Q9P2U8 582 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 MAGEB16A2A368 324 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 AP3B1O00203 1094 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 ATP9BO43861 1147 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 KRT37O76014 449 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 PENKP01210 267 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 CD70P32970 193 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 LMAN2Q12907 356 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 IHHQ14623 411 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 KDELC1Q6UW63 502 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 TAX1BP1Q86VP1 789 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 TTC8Q8TAM2 541 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 NSMCE1Q8WV22 266 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 FEM1AQ9BSK4 669 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 FICDQ9BVA6 458 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 C5orf42Q9H799 3197 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 CHRAC1Q9NRG0 131 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 MYOFQ9NZM1 2061 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 GRID1Q9ULK0 1009 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 SOX13Q9UN79 622 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 ACTL7AQ9Y615 435 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 FAM169AQ9Y6X4 670 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 SNAP91O60641 907 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 PRAMEF11O60813 436 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 PMPCBO75439 489 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 USP1O94782 785 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 NFATC1O95644 943 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 ADH1CP00326 375 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 MMP2P08253 660 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 ERVK-10P10266 1014 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 PYGBP11216 843 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 ADH5P11766 374 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 FOXN2P32314 431 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 SERPINB9P50453 376 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 MGAT5Q09328 741 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 BMPR2Q13873 1038 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 LGSNQ5TDP6 509 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 ZNF449Q6P9G9 518 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 RANBP10Q6VN20 620 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 CPLX4Q7Z7G2 160 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 MFSD6LQ8IWD5 586 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 APCDD1Q8J025 514 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 PGBD5Q8N414 524 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 FIBINQ8TAL6 211 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 ATP2A3Q93084 1043 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 E2F7Q96AV8 911 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 MFSD3Q96ES6 412 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 CERS2Q96G23 380 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 MAGEB18Q96M61 343 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 ABCB8Q9NUT2 735 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 PSAT1Q9Y617 370 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN8-204ENST00000519254 TCP11X1B4DZS4 312 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 KDELR3O43731 214 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 RFPL1O75677 317 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 KRT38O76015 456 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 ZWINTO95229 277 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 PSMC3P17980 439 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 NEK3P51956 506 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 WNT3AP56704 352 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 MAXP61244 160 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 IL9RQ01113 521 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 MPP3Q13368 585 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 NAB1Q13506 487 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 GPR153Q6NV75 609 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 LINGO4Q6UY18 593 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 ZNF783Q6ZMS7 281 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 TCP10LQ8TDR4 215 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 CDKL2Q92772 493 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 ELSPBP1Q96BH3 223 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 MTBPQ96DY7 904 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 FAM83CQ9BQN1 747 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 KIFC1Q9BW19 673 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 PDFQ9HBH1 243 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 NUMBLQ9Y6R0 609 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 BRWD1Q9NSI6 2320 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 MBTPS2O43462 519 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 VIMP08670 466 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 TAC1P20366 129 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 NMBRP28336 390 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 HLA-FP30511 346 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms