RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517483.5

TMPRSS4-202, Transcript of transmembrane serine protease 4, humanhuman

TSL 2

Gene TMPRSS4, Length 2,074 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4-202ENST00000517483 ABHD8Q96I13 439 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 VPS39Q96JC1 886 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 GPR22Q99680 433 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 APBA2Q99767 749 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 NEURL2Q9BR09 285 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 FLRT1Q9NZU1 646 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 SELENONQ9NZV5 590 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 TMEM9Q9P0T7 183 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 TMEM181Q9P2C4 612 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 FADS3Q9Y5Q0 445 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 NPHS1O60500 1241 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 C7P10643 843 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 COL6A2P12110 1019 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 CKMT2P17540 419 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 HALP42357 657 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 SNX16P57768 344 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 ZBTB17Q13105 803 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 FAM45BPQ6NSW5 357 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 NANOGP8Q6NSW7 305 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 NIPAL1Q6NVV3 410 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 HACD2Q6Y1H2 254 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 GK5Q6ZS86 529 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 CAMK1DQ8IU85 385 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 CENPSQ8N2Z9 138 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 ZNF786Q8N393 782 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 FAM45AQ8TCE6 357 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 NT5C1AQ9BXI3 368 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 ASB7Q9H672 318 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 LRRC4Q9HBW1 653 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 ANLNQ9NQW6 1124 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 SMOXQ9NWM0 555 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 TMEM247A6NEH6 219 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 HAS3O00219 553 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 GIPC1O14908 333 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 SULT1C4O75897 302 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 ESRRBO95718 433 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 FUCA1P04066 466 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 UGT1A6P19224 532 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 UGT1A1P22309 533 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 UGT1A4P22310 534 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 UGT1A3P35503 534 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 UGT1A5P35504 534 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 CPT1AP50416 773 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 GALNT2Q10471 571 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 REP15Q6BDI9 236 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 SCUBE3Q8IX30 993 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 ZNF567Q8N184 647 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 HMGCLL1Q8TB92 370 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 SLC35F5Q8WV83 523 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 TSNARE1Q96NA8 513 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 MAGEB5Q9BZ81 275 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 CCDC68Q9H2F9 335 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 TLK1Q9UKI8 766 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 VANGL2Q9ULK5 521 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa14.63□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 LACTBL1A8MY62 500 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 MFSD11O43934 449 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 SNAP91O60641 907 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 ADAM23O75077 832 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 E2F6O75461 281 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 STAU1O95793 577 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 GNAO1P09471 354 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 GOT1P17174 413 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 FUT4P22083 530 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 CD151P48509 253 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 PRAMEP78395 509 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 SQLEQ14534 574 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 SLC36A3Q495N2 470 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 TLK2Q86UE8 772 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 TMEM192Q8IY95 271 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 ACVR1CQ8NER5 493 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 OR52K1Q8NGK4 314 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 OR2T34Q8NGX1 318 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 OR2T3Q8NH03 318 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 HPDLQ96IR7 371 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 ADI1Q9BV57 179 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 ADAMTS10Q9H324 1103 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 CD320Q9NPF0 282 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 C8orf4Q9NR00 106 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 BFARQ9NZS9 450 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 MAGEB16A2A368 324 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 HTR3EA5X5Y0 456 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 K7EPI3 171 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 CA12O43570 354 aa14.62□□□□□ -0.07
TMPRSS4-202ENST00000517483 TIPRLO75663 272 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.5 ms