RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515159.5

SLC38A9-222, Transcript of solute carrier family 38 member 9, human

TSL 2

Gene SLC38A9, Length 3,509 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC38A9-222	ENST00000515159	HMGN1	P05114	100 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	MYL3	P08590	195 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	HSD17B1	P14061	328 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	CCNA2	P20248	432 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	PSMA3	P25788	255 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	SHMT2	P34897	504 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	CDKN2B	P42772	138 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	CASP4	P49662	377 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ATP4B	P51164	291 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	CLCN5	P51795	746 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	MERTK	Q12866	999 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	HYAL2	Q12891	473 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZBTB17	Q13105	803 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ACOX1	Q15067	660 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	LTB4R	Q15722	352 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	GRTP1	Q5TC63	336 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	PNCK	Q6P2M8	343 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	AKAP14	Q86UN6	197 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	UROC1	Q96N76	676 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	CPXM1	Q96SM3	734 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	KCNK16	Q96T55	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	IFT22	Q9H7X7	185 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ASAH2	Q9NR71	780 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	MARK1	Q9P0L2	795 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	MAFF	Q9ULX9	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159		V9GYH0	126 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	VWA5A	O00534	786 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	AURKA	O14965	403 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	TLL1	O43897	1013 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	PIAS1	O75925	651 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	IL10	P22301	178 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	HLA-DMA	P28067	261 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	CALCR	P30988	508 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	PRIM2	P49643	509 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	CLCNKA	P51800	687 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	AMPD3	Q01432	767 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	DOC2B	Q14184	412 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	MTX3	Q5HYI7	312 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	RNF180	Q86T96	592 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	MAGED4	Q96JG8	741 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	RDH12	Q96NR8	316 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	NUF2	Q9BZD4	464 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	DUSP21	Q9H596	190 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	NIPAL2	Q9H841	368 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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