RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498438.1

HOXD11-202, Transcript of homeobox D11, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HOXD11, Length 1,259 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-202ENST00000498438 GJC1P36383 396 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 RXRGP48443 463 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 CDH6P55285 790 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 IL10RBQ08334 325 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 KRT81Q14533 505 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 HADHQ16836 314 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 TTC7BQ86TV6 843 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 PNPLA1Q8N8W4 532 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 CHP1Q99653 195 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 FRYQ5TBA9 3013 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 SHROOM3Q8TF72 1996 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 A6NNZ2 444 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 PROSCO94903 275 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 TMEM253P0C7T8 217 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 TIMP2P16035 220 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 BNIP3Q12983 259 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 SGCGQ13326 291 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 GRM3Q14832 879 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 SARM1Q6SZW1 724 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 SLCO6A1Q86UG4 719 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 CNGA4Q8IV77 575 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 CALN1Q9BXU9 219 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 SPTLC3Q9NUV7 552 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 TOR4AQ9NXH8 423 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 FTSJ1Q9UET6 329 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 KLK13Q9UKR3 277 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 AKAP13Q12802 2813 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 TSPAN11A1L157 253 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 MUSKO15146 869 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 CD48P09326 243 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 ITIH2P19823 946 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 XPAP23025 273 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 SERPINB6P35237 376 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 CSNK1DP48730 415 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 MMRN1Q13201 1228 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 TMCO4Q5TGY1 634 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 SRLQ86TD4 932 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 CAMK1DQ8IU85 385 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 ATPAF2Q8N5M1 289 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 FAM71BQ8TC56 605 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 CXorf40AQ8TE69 158 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 BMFQ96LC9 184 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 CCDC42Q96M95 316 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 TRIM5Q9C035 493 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 SUV39H2Q9H5I1 410 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 KLHL11Q9NVR0 708 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 LRRK1Q38SD2 2015 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 IGF2RP11717 2491 aa18.58■□□□□ 0.57
HOXD11-202ENST00000498438 POM121BA6NF01 834 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-202ENST00000498438 GOLGA8CPA6NN73 597 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-202ENST00000498438 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-202ENST00000498438 TNFSF14O43557 240 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-202ENST00000498438 SDC3O75056 442 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-202ENST00000498438 IL4RP24394 825 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-202ENST00000498438 ARSEP51690 589 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-202ENST00000498438 TAS2R40P59535 323 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-202ENST00000498438 SLC10A7Q0GE19 358 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-202ENST00000498438 DPYSL3Q14195 570 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-202ENST00000498438 LBRQ14739 615 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-202ENST00000498438 CFAP58Q5T655 872 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-202ENST00000498438 Q6ZSR6 202 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-202ENST00000498438 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-202ENST00000498438 FAM174AQ8TBP5 190 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-202ENST00000498438 HCAR2Q8TDS4 363 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-202ENST00000498438 ASB12Q8WXK4 309 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-202ENST00000498438 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-202ENST00000498438 ZNF599Q96NL3 588 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-202ENST00000498438 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-202ENST00000498438 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-202ENST00000498438 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-202ENST00000498438 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-202ENST00000498438 GPR27Q9NS67 375 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-202ENST00000498438 SEPT3Q9UH03 358 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-202ENST00000498438 LCMT1Q9UIC8 334 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-202ENST00000498438 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXD11-202ENST00000498438 ASPMQ8IZT6 3477 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXD11-202ENST00000498438 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms