RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494549.1

ACTR1A-206, Transcript of ARP1 actin related protein 1 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene ACTR1A, Length 520 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1A-206ENST00000494549 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP8.67□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 DLL3Q9NYJ7 618 aa8.67□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa8.67□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 SLC25A13Q9UJS0 675 aa8.67□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 ACACBO00763 2458 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 ZFHX4Q86UP3 3567 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 TSPAN11A1L157 253 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 PATE3B3GLJ2 98 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 CCDC188H7C350 402 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 MUSKO15146 869 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 SLC7A4O43246 635 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 MAFKO60675 156 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 GJB3O75712 270 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 PALMO75781 387 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 TMCC1O94876 653 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 ADH1BP00325 375 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 NR1D1P20393 614 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 KDELR1P24390 212 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 CHRNA3P32297 505 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 LSP1P33241 339 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 RGRP47804 291 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 CCR5P51681 352 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 ADPRHP54922 357 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 CNTN1Q12860 1018 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 PPP2R5EQ16537 467 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 AGBL2Q5U5Z8 902 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 PRR23CQ6ZRP0 262 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 PGBD3Q8N328 593 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 LZTR1Q8N653 840 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 LRRC57Q8N9N7 239 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 ATP11CQ8NB49 1132 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 NETO2Q8NC67 525 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 P3H4Q92791 437 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 ARL8AQ96BM9 186 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 TSGA13Q96PP4 275 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 ZNF670Q9BS34 389 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 SPON2Q9BUD6 331 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 GPR174Q9BXC1 333 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 SMOC1Q9H4F8 434 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 ZWILCHQ9H900 591 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 TMBIM4Q9HC24 238 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 VPS45Q9NRW7 570 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 FBXL12Q9NXK8 326 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 NCDNQ9UBB6 729 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 RAB23Q9ULC3 237 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 AKAP13Q12802 2813 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 ZZEF1O43149 2961 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 LRP4O75096 1905 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 A0A1W2PP55 124 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 LNP1A1A4G5 178 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 H3BRJ5 948 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 PLK4O00444 970 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 AREL1O15033 823 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 INSIG1O15503 277 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 GDF9O60383 454 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 SEMA4FO95754 770 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 FAM107AO95990 144 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 DNTTP04053 509 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 KRT7P08729 469 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 CXCR5P32302 372 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 NNMTP40261 264 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 MDH1P40925 334 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 SLC1A1P43005 524 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 CARSP49589 748 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 PEX5P50542 639 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 CDH6P55285 790 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 IRX4P78413 519 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 GUCY2DQ02846 1103 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 IL10RBQ08334 325 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 GALNT2Q10471 571 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 MESDQ14696 234 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 PDK2Q15119 407 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 RPS6KA1Q15418 735 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 CCDC6Q16204 474 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 MYLK3Q32MK0 819 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 TMEM259Q4ZIN3 620 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 LYSMD4Q5XG99 296 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 SLC9A4Q6AI14 798 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 IL31Q6EBC2 164 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 ALG1LQ6GMV1 187 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTR1A-206ENST00000494549 TCEAL6Q6IPX3 200 aa8.65□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms