RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 TBCBQ99426 244 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 ZNF408Q9H9D4 720 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 CACNG4Q9UBN1 327 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 VPS51Q9UID3 782 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 AP4E1Q9UPM8 1137 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 RAP2CQ9Y3L5 183 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 PLXNB2O15031 1838 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 G3V2L1 256 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 H0YJX3 145 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 GOLGA8TH3BQL2 631 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 CLOCKO15516 846 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 NDUFB5O43674 189 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 MAGEA3P43357 314 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 NIPAL4Q0D2K0 466 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 TNIP2Q8NFZ5 429 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 TMEM40Q8WWA1 233 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 NDEL1Q9GZM8 345 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 DRC3Q9H069 523 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa13.61□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 KRBA1A5PL33 1030 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 SOBPA7XYQ1 873 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 TMEM233B4DJY2 109 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 RECQL4O94761 1208 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 MMP3P08254 477 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 CCNA2P20248 432 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 TKTP29401 623 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 OLIG2Q13516 323 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 PLCL1Q15111 1095 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 FSTL4Q6MZW2 842 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 FAM110BQ8TC76 370 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 SLC2A14Q8TDB8 520 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 FBXL20Q96IG2 436 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 TSNARE1Q96NA8 513 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 CSPG4P5Q96PW8 444 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 ZNF670Q9BS34 389 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 ADI1Q9BV57 179 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 ADAMTS10Q9H324 1103 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 GNPTGQ9UJJ9 305 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 CDH7Q9ULB5 785 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 KIAA1257Q9ULG3 409 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 PRORSD1PA6NEY8 169 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 MDM4O15151 490 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 STAU1O95793 577 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 C2P06681 752 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 POLBP06746 335 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 GABRB3P28472 473 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 SLC7A1P30825 629 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 SPRP35270 261 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 SOX11P35716 441 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 ZBTB6Q15916 424 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 C9orf57Q5W0N0 161 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 HMBOX1Q6NT76 420 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 ARMCX6Q7L4S7 300 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 SLCO4A1Q96BD0 722 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 ITPKCQ96DU7 683 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 AGAP2Q99490 1192 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 SLC39A3Q9BRY0 314 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 SYBUQ9NX95 663 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 DTLQ9NZJ0 730 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 SLC39A10Q9ULF5 831 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 ERGIC3Q9Y282 383 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 ST14Q9Y5Y6 855 aa13.6□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 TMEM114B3SHH9 223 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 CLDN5O00501 218 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 TADA2AO75478 443 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 NR4A1P22736 598 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 DMPKQ09013 629 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 BFSP2Q13515 415 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 AGKQ53H12 422 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 CCDC138Q96M89 665 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 IL1RL2Q9HB29 575 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 CCDC78A2IDD5 438 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 PDHXO00330 501 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 GRID2O43424 1007 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 USP12O75317 370 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 GPR32O75388 356 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 SULT1C4O75897 302 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 CAPNS1P04632 268 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 C8BP07358 591 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 TPSB2P20231 275 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 NME5P56597 212 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 MERTKQ12866 999 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 NFATC3Q12968 1075 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 PRPSAP1Q14558 356 aa13.59□□□□□ -0.23
NISCH-212ENST00000488380 TPSAB1Q15661 275 aa13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms