RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 GAGE4Q13068 117 aa2.83□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa2.83□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 SHFQ7M4L6 423 aa2.83□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 MON1AQ86VX9 555 aa2.83□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 ODF3L1Q8IXM7 274 aa2.83□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 CADM4Q8NFZ8 388 aa2.83□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 BBS10Q8TAM1 723 aa2.83□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 MUL1Q969V5 352 aa2.83□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 ZNF583Q96ND8 569 aa2.83□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 UBXN6Q9BZV1 441 aa2.83□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 CSTL1Q9H114 145 aa2.83□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 POU2F3Q9UKI9 436 aa2.83□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 SLC39A10Q9ULF5 831 aa2.83□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa2.83□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 CACNA1FO60840 1977 aa2.83□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 ANO9A1A5B4 782 aa2.82□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 DVL1O14640 695 aa2.82□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 MID1O15344 667 aa2.82□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 HSPA12AO43301 675 aa2.82□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 ZIC3O60481 467 aa2.82□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 MYL3P08590 195 aa2.82□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 CDH1P12830 882 aa2.82□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 NR1D1P20393 614 aa2.82□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 MYF6P23409 242 aa2.82□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 AVPR2P30518 371 aa2.82□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 PTPN9P43378 593 aa2.82□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 HDAC4P56524 1084 aa2.82□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 RELQ04864 619 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 SLC20A2Q08357 652 aa2.82□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP2.82□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 DCAF6Q58WW2 860 aa2.82□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 ARHGAP17Q68EM7 881 aa2.82□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 WDR73Q6P4I2 378 aa2.82□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 GALNT7Q86SF2 657 aa2.82□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 FMNL3Q8IVF7 1028 aa2.82□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 NPAS1Q99742 590 aa2.82□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 KATNAL1Q9BW62 490 aa2.82□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP2.82□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 GRHL1Q9NZI5 618 aa2.82□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 FNIP2Q9P278 1114 aa2.82□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 NLKQ9UBE8 527 aa2.82□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 CPED1A4D0V7 1026 aa2.81□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 FAM90A18PA6NE21 464 aa2.81□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 FAM90A16PA6NEW6 464 aa2.81□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa2.81□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa2.81□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 FAM157AC9JC47 383 aa2.81□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 FGF18O76093 207 aa2.81□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 TFRCP02786 760 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 FAM90A15PP0C7V4 464 aa2.81□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 FAM90A14PP0C7W9 464 aa2.81□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 SP100P23497 879 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 HSPA7P48741 367 aa2.81□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 RPS6KA2Q15349 733 aa2.81□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 OASLQ15646 514 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 MPEG1Q2M385 716 aa2.81□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 AP5B1Q2VPB7 878 aa2.81□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 AADACL2Q6P093 401 aa2.81□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 CEACAM20Q6UY09 585 aa2.81□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 NFE4Q86UQ8 179 aa2.81□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 GATAD2AQ86YP4 633 aa2.81□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 DENND6AQ8IWF6 608 aa2.81□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 OR10V1Q8NGI7 309 aa2.81□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 SPATA22Q8NHS9 363 aa2.81□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 TTC17Q96AE7 1141 aa2.81□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 PIGSQ96S52 555 aa2.81□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 YME1L1Q96TA2 773 aa2.81□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 RPS10P5Q9NQ39 176 aa2.81□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 SLC22A11Q9NSA0 550 aa2.81□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa2.8□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 A0A1W2PS18 150 aa2.8□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 LILRA5A6NI73 299 aa2.8□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 AQP12BA6NM10 295 aa2.8□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 ATP2C2O75185 946 aa2.8□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 RPS6KA3P51812 740 aa2.8□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 ME3Q16798 604 aa2.8□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa2.8□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 LCTLQ6UWM7 567 aa2.8□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 PJA1Q8NG27 643 aa2.8□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 OR4N2Q8NGD1 307 aa2.8□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 LGALS12Q96DT0 336 aa2.8□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 PRDM8Q9NQV8 689 aa2.8□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 TM7SF3Q9NS93 570 aa2.8□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 BAG5Q9UL15 447 aa2.8□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 ASPDHA6ND91 283 aa2.79□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 OR6C68A6NDL8 312 aa2.79□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 C17orf100A8MU93 164 aa2.79□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 SOCS6O14544 535 aa2.79□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 RGS11O94810 467 aa2.79□□□□□ -1.96
SENP6-210ENST00000487548 TNFRSF6BO95407 300 aa2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms