RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481368.5

SNHG12-209, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG12, Length 1,588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12-209ENST00000481368 CD48P09326 243 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 OVGP1Q12889 678 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 SLC45A4Q5BKX6 768 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 VPS36Q86VN1 386 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 MARCH9Q86YJ5 346 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 FEM1CQ96JP0 617 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 CSPG4P5Q96PW8 444 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 CHP1Q99653 195 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 PCDH18Q9HCL0 1135 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 ARHGAP42A6NI28 874 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 GOLGA8CPA6NN73 597 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 TRIM16O95361 564 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 AKT2P31751 481 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 ARSEP51690 589 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 SLC18A3Q16572 532 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 BOLA3Q53S33 107 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 TTC7BQ86TV6 843 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 CAMK1DQ8IU85 385 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 SLC25A45Q8N413 288 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 OR8K1Q8NGG5 319 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 RAB7BQ96AH8 199 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 CDC6Q99741 560 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 UCKL1Q9NWZ5 548 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 DKK3Q9UBP4 350 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 IP6K2Q9UHH9 426 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 MSRB2Q9Y3D2 182 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 TSPAN11A1L157 253 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 TNFSF14O43557 240 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 TSPAN6O43657 245 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 MMP20O60882 483 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 PALMO75781 387 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 PRKCGP05129 697 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 ITGAVP06756 1048 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 GIMD1P0DJR0 217 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 ADKP55263 362 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 SEMG2Q02383 582 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 SLC10A7Q0GE19 358 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 MMRN1Q13201 1228 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 DNAJC3Q13217 504 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 Q6ZSR6 202 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 EID2Q8N6I1 236 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 FAM71BQ8TC56 605 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 TEKT4Q8WW24 435 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 CENPTQ96BT3 561 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 CALN1Q9BXU9 219 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 ABHD10Q9NUJ1 306 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 KLF15Q9UIH9 416 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SNHG12-209ENST00000481368 MYO1FO00160 1098 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 MFAP3LO75121 409 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 TPM3P06753 285 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 TAS2R40P59535 323 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 IL10RBQ08334 325 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 ST3GAL2Q16842 350 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 ZNF542PQ5EBM4 170 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 PGBD5Q8N414 524 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 NCAPGQ9BPX3 1015 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 SUV39H2Q9H5I1 410 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 SP110Q9HB58 689 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 KLHL11Q9NVR0 708 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 DONSONQ9NYP3 566 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 MYLKQ15746 1914 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 A6NNZ2 444 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 H3BRJ5 948 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 TRIM38O00635 465 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 NEMP1O14524 444 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 YKT6O15498 198 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 CBFA2T2O43439 604 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 MAFKO60675 156 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 MAGEC1O60732 1142 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 CAPNS1P04632 268 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 PROS1P07225 676 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 IGFALSP35858 605 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 CLDN6P56747 220 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 PFN3P60673 137 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 RAD51Q06609 339 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 FZD2Q14332 565 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 UGP2Q16851 508 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 SRLQ86TD4 932 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 OXR1Q8N573 874 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG12-209ENST00000481368 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms