RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465846.6

HOXB-AS3-203, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 434 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RAXQ9Y2V3 346 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GPSM3Q9Y4H4 160 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TMEM191CA6NGB0 347 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 INSIG1O15503 277 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FTLP02792 175 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GIMD1P0DJR0 217 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GZMAP12544 262 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NDST2P52849 883 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP18.45■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KLHL30Q0D2K2 578 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CYTH1Q15438 398 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ERMARDQ5T6L9 678 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TTC7BQ86TV6 843 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PARGQ86W56 976 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FNIP1Q8TF40 1166 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ZNF653Q96CK0 615 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NCAPGQ9BPX3 1015 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DKK3Q9UBP4 350 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LHX6Q9UPM6 363 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 J3KR12 359 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PRAMEF11O60813 436 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PIGNO95427 931 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SERPINC1P01008 464 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ALPPL2P10696 532 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NME1P15531 152 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PFN3P60673 137 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DAB2P98082 770 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NR1I3Q14994 352 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TPRG1LQ5T0D9 272 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KDM7AQ6ZMT4 941 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CXorf40AQ8TE69 158 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 EDEM3Q9BZQ6 932 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NLGN3Q9NZ94 848 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SCINQ9Y6U3 715 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MYLKQ15746 1914 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ARHGAP42A6NI28 874 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 H3BM21 787 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SCAMP1O15126 338 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PRPSAP2O60256 369 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RNF8O76064 485 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CSF2P04141 144 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SKILP12757 684 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TIMP2P16035 220 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ITIH2P19823 946 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MIPP30301 263 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 IGFALSP35858 605 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP18.43■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FIGNQ5HY92 759 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RFX8Q6ZV50 586 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 VPS36Q86VN1 386 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RFFLQ8WZ73 363 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CENPTQ96BT3 561 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NXPE2Q96DL1 559 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TRIM11Q96F44 468 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SLC39A8Q9C0K1 460 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ADAMTS20P59510 1910 aa18.43■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TSPAN11A1L157 253 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NEMP2A6NFY4 417 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DAPK3O43293 454 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MMP20O60882 483 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LRCH4O75427 683 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NEBLO76041 1014 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TM7SF2O76062 418 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MYBL1P10243 752 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CKMT1AP12532 417 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GRM3Q14832 879 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 AFMIDQ63HM1 303 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 C19orf48Q6RUI8 117 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 APOLD1Q96LR9 279 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CBX8Q9HC52 389 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MYO1AQ9UBC5 1043 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KLF15Q9UIH9 416 aa18.42■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LRRK1Q38SD2 2015 aa18.41■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa18.41■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SYCE3A1L190 88 aa18.41■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 K7ESM1 405 aa18.41■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 JUNDP17535 347 aa18.41■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ERCC2P18074 760 aa18.41■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 XPAP23025 273 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SUOXP51687 545 aa18.41■□□□□ 0.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 E2F1Q01094 437 aa18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms