RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 A0A1W2PR77 199 aa25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 AP1G1O43747 822 aa25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 XPAP23025 273 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 NUDT1P36639 197 aa25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 CSNK1DP48730 415 aa25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 RENBPP51606 427 aa25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 GBE1Q04446 702 aa25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 STAT4Q14765 748 aa25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM139Q8IV31 216 aa25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 PSKH2Q96QS6 385 aa25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 DKK3Q9UBP4 350 aa25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM131Q92545 1883 aa25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 IGLON5A6NGN9 336 aa25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 SPINT1O43278 529 aa25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 CER1O95813 267 aa25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 GARSP41250 739 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 CTSKP43235 329 aa25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 RPS21P63220 83 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 GALNT2Q10471 571 aa25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 GRM3Q14832 879 aa25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM259Q4ZIN3 620 aa25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC45A4Q5BKX6 768 aa25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 CFAP58Q5T655 872 aa25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 MARC1Q5VT66 337 aa25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 ERMP1Q7Z2K6 904 aa25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 PGBD5Q8N414 524 aa25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 PAF1Q8N7H5 531 aa25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 SKA1Q96BD8 255 aa25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 NSMCE3Q96MG7 304 aa25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC17A9Q9BYT1 436 aa25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1-202ENST00000425695 ANKRD36A6QL64 1941 aa25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 TSPAN6O43657 245 aa25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 CD59P13987 128 aa25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 MMP13P45452 471 aa25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 MAXP61244 160 aa25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 BCL2L1Q07817 233 aa25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 LLGL1Q15334 1064 aa25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 KIAA1328Q86T90 577 aa25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 RFX6Q8HWS3 928 aa25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 LRRC49Q8IUZ0 686 aa25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 BBS5Q8N3I7 341 aa25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 DEFB124Q8NES8 71 aa25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 TPCN2Q8NHX9 752 aa25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 LACRTQ9GZZ8 138 aa25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 H0Y8X5 98 aa25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 TLR4O00206 839 aa25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 GIPC1O14908 333 aa25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 AREL1O15033 823 aa25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 KCNK5O95279 499 aa25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 SERPINA4P29622 427 aa25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 AKT2P31751 481 aa25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 SEMG2Q02383 582 aa25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 SGCGQ13326 291 aa25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 FGL2Q14314 439 aa25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 MFSD7Q6UXD7 560 aa25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 DAAM2Q86T65 1068 aa25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 MFSD2AQ8NA29 543 aa25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 DESI2Q9BSY9 194 aa25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 NT5MQ9NPB1 228 aa25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 TM7SF3Q9NS93 570 aa25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 DTLQ9NZJ0 730 aa25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 HEY1Q9Y5J3 304 aa25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 DNAH14Q0VDD8 3507 aa25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 MMP20O60882 483 aa25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 PRKCGP05129 697 aa25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 VAV2P52735 878 aa25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 CLDN2P57739 230 aa25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 DYNLT1P63172 113 aa25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 IL9RQ01113 521 aa25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 ITKQ08881 620 aa25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 UGP2Q16851 508 aa25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 ZSWIM9Q86XI8 627 aa25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 PLD5Q8N7P1 536 aa25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 CCNYQ8ND76 341 aa25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 HCAR2Q8TDS4 363 aa25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 NOD2Q9HC29 1040 aa25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1-202ENST00000425695 SCUBE2Q9NQ36 999 aa25.24■■□□□ 1.63
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