RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 UPP2O95045 317 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 MED26O95402 600 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 PARNO95453 639 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 GSNP06396 782 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 ITGB6P18564 788 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 IL1R2P27930 398 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 ASPAP45381 313 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 GPX6P59796 221 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 SEMA5AQ13591 1074 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 RGS21Q2M5E4 152 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 FSTL4Q6MZW2 842 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 LGI2Q8N0V4 545 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 UCMAQ8WVF2 138 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 ROGDIQ9GZN7 287 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 MARCH2Q9P0N8 246 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 ZMYM5Q9UJ78 669 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 KCNH4Q9UQ05 1017 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 H3BNX3 289 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 IPO13O94829 963 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 TCF4P15884 667 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 HUNKP57058 714 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 ATP6V0D1P61421 351 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 UBE3AQ05086 875 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 RNF180Q86T96 592 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF567Q8N184 647 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF570Q96NI8 536 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 SPON1Q9HCB6 807 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 SQORQ9Y6N5 450 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 MYH6P13533 1939 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 ADCY6O43306 1168 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 SCNN1GP51170 649 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 GRM3Q14832 879 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 BRMS1LQ5PSV4 323 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM228AQ86W67 206 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 GPC2Q8N158 579 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 MFSD3Q96ES6 412 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 EBF4Q9BQW3 602 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa16.5■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 TRIM24O15164 1050 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 BUD23O43709 281 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 POU1F1P28069 291 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 CDH13P55290 713 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 ITGADQ13349 1161 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC39A12Q504Y0 691 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 UBR7Q8N806 425 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 SPPL2AQ8TCT8 520 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 HDAC10Q969S8 669 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 SPATA17Q96L03 361 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 ZYG11BQ9C0D3 744 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 GBA3Q9H227 469 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 EBF3Q9H4W6 596 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 PDZD7Q9H5P4 517 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 EGFL7Q9UHF1 273 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 COL1A2P08123 1366 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 SNTNA6NMZ2 147 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 CFHP08603 1231 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 HSMCR30P0CW71 290 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 GPD2P43304 727 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 CNTN1Q12860 1018 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM187BQ17R55 369 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 ARMCX4Q5H9R4 360 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 LBX2Q6XYB7 198 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 RAET1EQ8TD07 263 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM245Q9H330 911 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 BTRCQ9Y297 605 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 MTX3Q5HYI7 312 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF618Q5T7W0 954 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 RSPH1Q8WYR4 309 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 KLRG1Q96E93 195 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 PGLYRP2Q96PD5 576 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 CIB1Q99828 191 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 SEMA3CQ99985 751 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 UNC93B1Q9H1C4 597 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 VPS45Q9NRW7 570 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 LRRC42Q9Y546 428 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 ADM5C9JUS6 153 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 TIPRLO75663 272 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 AQP4P55087 323 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 GPR107Q5VW38 600 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 TRAF7Q6Q0C0 670 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 TBC1D21Q8IYX1 336 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 CEP44Q9C0F1 390 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 RAD21L1Q9H4I0 556 aa16.49■□□□□ 0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 HPS4Q9NQG7 708 aa16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms