RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365430.1

RNU6-487P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 487, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-487P, Length 104 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-487P-201ENST00000365430 SIN3AQ96ST3 1273 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLF1Q9BQI6 1058 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 MVB12BQ9H7P6 319 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 PDE7BQ9NP56 450 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 THSD1Q9NS62 852 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 MST1RQ04912 1400 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 WDR17Q8IZU2 1322 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 DPPA5A6NC42 116 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 LINC01548A6NM66 108 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 KLRF2D3W0D1 207 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 KLK8O60259 260 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 ENTPD3O75355 529 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 RGS11O94810 467 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 KCNK5O95279 499 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 TFP02787 698 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 CYC1P08574 325 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 UNGP13051 313 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 SRD5A1P18405 259 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 SHMT1P34896 483 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 RYKP34925 604 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 CLCNKBP51801 687 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 LRMPQ12912 555 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 CHAF1BQ13112 559 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 STIM1Q13586 685 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 ACVR2BQ13705 512 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 MMEL1Q495T6 779 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 Q4G0T1 1027 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 ESCO2Q56NI9 601 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 ALG10Q5BKT4 473 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 BMP2KLQ5H9B9 411 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 ALG10BQ5I7T1 473 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 MFSD4BQ5TF39 518 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 ATG9BQ674R7 924 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 AAGABQ6PD74 315 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF813Q6ZN06 617 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM57BQ71RH2 274 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 TBC1D26Q86UD7 250 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMTC2Q8N394 836 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 PARP16Q8N5Y8 322 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM47BQ8NA70 645 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 C11orf65Q8NCR3 313 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 CEP76Q8TAP6 659 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 SCFD2Q8WU76 684 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 HDAC7Q8WUI4 952 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 SMARCE1Q969G3 411 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 ABHD1Q96SE0 405 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 GAD1Q99259 594 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 MXRA8Q9BRK3 442 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 PCED1AQ9H1Q7 454 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 CCDC68Q9H2F9 335 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 SYNCQ9H7C4 482 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 KAT14Q9H8E8 782 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC28A3Q9HAS3 691 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 SETD4Q9NVD3 440 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM45AQ9NWC5 275 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 MSRB1Q9NZV6 116 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 NENFQ9UMX5 172 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 COG5Q9UP83 839 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 MYRFQ9Y2G1 1151 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM96BQ9Y3D0 163 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 A3GALT2U3KPV4 340 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 KAT6BQ8WYB5 2073 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 A0A0U1RQF3 1178 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 C1orf226A1L170 272 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 LRRC53A6NM62 1247 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 KCNU1A8MYU2 1149 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 A8MZ25 164 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 HSPB6O14558 160 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 SEC14L5O43304 696 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 FZD7O75084 574 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 CCNDBP1O95273 360 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-487P-201ENST00000365430 LATS1O95835 1130 aa2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms