RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354376.3

C9orf163-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 163, humanhuman

Gene C9orf163, Length 2,572 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf163-201ENST00000354376 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
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C9orf163-201ENST00000354376 DLX3O60479 287 aa22.77■■□□□ 1.24
C9orf163-201ENST00000354376 UPP2O95045 317 aa22.77■■□□□ 1.24
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C9orf163-201ENST00000354376 DNAJC28Q9NX36 388 aa22.77■■□□□ 1.24
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C9orf163-201ENST00000354376 CLIC5Q9NZA1 410 aa22.77■■□□□ 1.24
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C9orf163-201ENST00000354376 DNAJB2P25686 324 aa22.76■■□□□ 1.23
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C9orf163-201ENST00000354376 RCN1Q15293 331 aa22.76■■□□□ 1.23
C9orf163-201ENST00000354376 FAM126BQ8IXS8 530 aa22.76■■□□□ 1.23
C9orf163-201ENST00000354376 HEXDCQ8WVB3 486 aa22.76■■□□□ 1.23
C9orf163-201ENST00000354376 BATF3Q9NR55 127 aa22.76■■□□□ 1.23
C9orf163-201ENST00000354376 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa22.76■■□□□ 1.23
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C9orf163-201ENST00000354376 IGLV3-27P01718 113 aa22.76■■□□□ 1.23
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C9orf163-201ENST00000354376 GCKP35557 465 aa22.76■■□□□ 1.23
C9orf163-201ENST00000354376 CD151P48509 253 aa22.76■■□□□ 1.23
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C9orf163-201ENST00000354376 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa22.76■■□□□ 1.23
C9orf163-201ENST00000354376 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
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C9orf163-201ENST00000354376 STYXQ8WUJ0 223 aa22.75■■□□□ 1.23
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C9orf163-201ENST00000354376 SEMA3CQ99985 751 aa22.75■■□□□ 1.23
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C9orf163-201ENST00000354376 EPHA3P29320 983 aa22.75■■□□□ 1.23
C9orf163-201ENST00000354376 SERINC3Q13530 473 aa22.75■■□□□ 1.23
C9orf163-201ENST00000354376 CSHL1Q14406 222 aa22.75■■□□□ 1.23
C9orf163-201ENST00000354376 GALNT3Q14435 633 aa22.75■■□□□ 1.23
C9orf163-201ENST00000354376 CFAP157Q5JU67 520 aa22.75■■□□□ 1.23
C9orf163-201ENST00000354376 ULK2Q8IYT8 1036 aa22.75■■□□□ 1.23
C9orf163-201ENST00000354376 HDAC10Q969S8 669 aa22.75■■□□□ 1.23
C9orf163-201ENST00000354376 SMIM14Q96QK8 99 aa22.75■■□□□ 1.23
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C9orf163-201ENST00000354376 OR6P1Q8NGX9 317 aa22.74■■□□□ 1.23
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C9orf163-201ENST00000354376 SCUBE1Q8IWY4 988 aa22.74■■□□□ 1.23
C9orf163-201ENST00000354376 CRIPAKQ8N1N5 446 aa22.74■■□□□ 1.23
C9orf163-201ENST00000354376 NRG4Q8WWG1 115 aa22.74■■□□□ 1.23
C9orf163-201ENST00000354376 SPDL1Q96EA4 605 aa22.74■■□□□ 1.23
C9orf163-201ENST00000354376 PANX3Q96QZ0 392 aa22.74■■□□□ 1.23
C9orf163-201ENST00000354376 SIKE1Q9BRV8 207 aa22.74■■□□□ 1.23
C9orf163-201ENST00000354376 NUF2Q9BZD4 464 aa22.74■■□□□ 1.23
C9orf163-201ENST00000354376 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.23
C9orf163-201ENST00000354376 ARNT2Q9HBZ2 717 aa22.74■■□□□ 1.23
C9orf163-201ENST00000354376 ARL5AQ9Y689 179 aa22.74■■□□□ 1.23
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