RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320122.10

LMO3-202, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,759 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-202ENST00000320122 METTL25Q8N6Q8 603 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 PDZD8Q8NEN9 1154 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 ZNF555Q8NEP9 628 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 CYGBQ8WWM9 190 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 LRTOMTQ8WZ04 291 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 LGMNQ99538 433 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 TRIM54Q9BYV2 358 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 POMKQ9H5K3 350 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 ZNF385DQ9H6B1 395 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 EPS8L2Q9H6S3 715 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 MEAF6Q9HAF1 191 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 ACTR3BQ9P1U1 418 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 ANAPC2Q9UJX6 822 aa6.52□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 ARID2Q68CP9 1835 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 GOLGA8TH3BQL2 631 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 M0QYT0 321 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 GRID2O43424 1007 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 IPO13O94829 963 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 NPPAP01160 153 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 HSD17B1P14061 328 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 CYP2B6P20813 491 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 PTPN3P26045 913 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 AXLP30530 894 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 TAF6P49848 677 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 NRLP54845 237 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 KCNK10P57789 538 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 DCAF6Q58WW2 860 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 SPATA19Q7Z5L4 167 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 FAM131BQ86XD5 332 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 DEFB106AQ8N104 65 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 FIBCD1Q8N539 461 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 TFAP2CQ92754 450 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 CYP2S1Q96SQ9 504 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 NPAS2Q99743 824 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 TBL1YQ9BQ87 522 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 MED10Q9BTT4 135 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 FSD1LQ9BXM9 530 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 FAM49BQ9NUQ9 324 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 RIPK3Q9Y572 518 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 TCAF2A6NFQ2 919 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 TRIM64CA6NLI5 447 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 GOLGA8CPA6NN73 597 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 C9IYK1 514 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 SDHDO14521 159 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 TULP3O75386 442 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 MAP3K6O95382 1288 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 EDNRBP24530 442 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 ADORA2BP29275 332 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 IREB2P48200 963 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 ORC1Q13415 861 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 GRM3Q14832 879 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 ACAP2Q15057 778 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 INAQ16352 499 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 PKDCCQ504Y2 493 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 CHSY3Q70JA7 882 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 EFCAB3Q8N7B9 438 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 RNF34Q969K3 372 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 NDEL1Q9GZM8 345 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 PLAC1Q9HBJ0 212 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 ANKHQ9HCJ1 492 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 HPS4Q9NQG7 708 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 GMIPQ9P107 970 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 FNIP2Q9P278 1114 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 PSAT1Q9Y617 370 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 GRXCR2A6NFK2 248 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 LBPP18428 481 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 PTPRAP18433 802 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 JAK1P23458 1154 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 DCKP27707 260 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 GRIA1P42261 906 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 GRIA3P42263 894 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 SCNN1BP51168 640 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 SLC7A2P52569 658 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 CRADDP78560 199 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 SCAPQ12770 1279 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 RFX4Q33E94 735 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 LCN8Q6JVE9 175 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 CNTN4Q8IWV2 1026 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 MYO1HQ8N1T3 1032 aa6.51□□□□□ -1.37
LMO3-202ENST00000320122 MINDY1Q8N5J2 469 aa6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms