RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CHTF18-202ENST00000317063 FYB2Q5VWT5 728 aa16.47■□□□□ 0.23
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CHTF18-202ENST00000317063 MRGPRX2Q96LB1 330 aa16.47■□□□□ 0.23
CHTF18-202ENST00000317063 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
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CHTF18-202ENST00000317063 LMAN2LQ9H0V9 348 aa16.47■□□□□ 0.23
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