RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267488.8

SLC38A6-201, Transcript of solute carrier family 38 member 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC38A6, Length 1,688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A6-201ENST00000267488 GDF3Q9NR23 364 aa14.48□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 SNX24Q9Y343 169 aa14.48□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 TTC28Q96AY4 2481 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 BNIP3LO60238 219 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 ADAM23O75077 832 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 SOCS5O75159 536 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 AP2A1O95782 977 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 EPOP01588 193 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 APRTP07741 180 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 TPSB2P20231 275 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 GUCY2DQ02846 1103 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 CALCOCO2Q13137 446 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 KCNJ11Q14654 390 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 STARD3Q14849 445 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 MORF4L2Q15014 288 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 TPSAB1Q15661 275 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 FAXCQ5TGI0 409 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 IZUMO3Q5VZ72 239 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 DSG4Q86SJ6 1040 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 HOOK3Q86VS8 718 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 OR8D1Q8WZ84 308 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 CPT1BQ92523 772 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 FAM129AQ9BZQ8 928 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 LRRC40Q9H9A6 602 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 EPB41L5Q9HCM4 733 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 MED4Q9NPJ6 270 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 FAM114A2Q9NRY5 505 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 IL36AQ9UHA7 158 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 MMP17Q9ULZ9 603 aa14.47□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 ATG13O75143 517 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 GJB3O75712 270 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 SUN1O94901 812 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 PRNPP04156 253 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 ALADP13716 330 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 HOXB2P14652 356 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 SERPINA4P29622 427 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 LMAN1P49257 510 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 CAV1Q03135 178 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 BCL2L1Q07817 233 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 IHHQ14623 411 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 KDELC1Q6UW63 502 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 LINC00523Q86TU6 105 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 NAT8LQ8N9F0 302 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 CHST14Q8NCH0 376 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 TMIEQ8NEW7 156 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 PJA1Q8NG27 643 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 CAVIN3Q969G5 261 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 VOPP1Q96AW1 172 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 CLDN23Q96B33 292 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 MRGPRX2Q96LB1 330 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 NSMCE3Q96MG7 304 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 FOXQ1Q9C009 403 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 DPH5Q9H2P9 285 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 MTG2Q9H4K7 406 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 UBP1Q9NZI7 540 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 WASF2Q9Y6W5 498 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 VCANP13611 3396 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 LRRK1Q38SD2 2015 aa14.46□□□□□ -0.09
SLC38A6-201ENST00000267488 A0A1W2PQ67 120 aa14.46□□□□□ -0.1
SLC38A6-201ENST00000267488 F5H423 210 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.1
SLC38A6-201ENST00000267488 H3BQF6 201 aa14.46□□□□□ -0.1
SLC38A6-201ENST00000267488 STK25O00506 426 aa14.46□□□□□ -0.1
SLC38A6-201ENST00000267488 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.1
SLC38A6-201ENST00000267488 PMPCBO75439 489 aa14.46□□□□□ -0.1
SLC38A6-201ENST00000267488 WASP42768 502 aa14.46□□□□□ -0.1
SLC38A6-201ENST00000267488 RPS9P46781 194 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.1
SLC38A6-201ENST00000267488 WNT3AP56704 352 aa14.46□□□□□ -0.1
SLC38A6-201ENST00000267488 SARNPP82979 210 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.1
SLC38A6-201ENST00000267488 CUL1Q13616 776 aa14.46□□□□□ -0.1
SLC38A6-201ENST00000267488 HSP90B2PQ58FF3 399 aa14.46□□□□□ -0.1
SLC38A6-201ENST00000267488 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.1
SLC38A6-201ENST00000267488 STK40Q8N2I9 435 aa14.46□□□□□ -0.1
SLC38A6-201ENST00000267488 OR6K2Q8NGY2 324 aa14.46□□□□□ -0.1
SLC38A6-201ENST00000267488 HCAR2Q8TDS4 363 aa14.46□□□□□ -0.1
SLC38A6-201ENST00000267488 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP14.46□□□□□ -0.15e-8■■■■■ 65.3
SLC38A6-201ENST00000267488 SPOCK2Q92563 424 aa14.46□□□□□ -0.1
SLC38A6-201ENST00000267488 FEM1CQ96JP0 617 aa14.46□□□□□ -0.1
SLC38A6-201ENST00000267488 FAM129BQ96TA1 746 aa14.46□□□□□ -0.1
SLC38A6-201ENST00000267488 FSD1LQ9BXM9 530 aa14.46□□□□□ -0.1
SLC38A6-201ENST00000267488 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.1
SLC38A6-201ENST00000267488 GRHL1Q9NZI5 618 aa14.46□□□□□ -0.1
SLC38A6-201ENST00000267488 ANAPC5Q9UJX4 755 aa14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms