RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263202.14

UFD1-201, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UFD1, Length 1,814 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1-201ENST00000263202 CASC4Q6P4E1 433 aa22.92■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 TERB1Q8NA31 727 aa22.92■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 CFAP36Q96G28 342 aa22.92■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 MYO19Q96H55 970 aa22.92■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa22.92■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 PLCD3Q8N3E9 789 aa22.91■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 NAT9Q9BTE0 207 aa22.91■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 CHKBQ9Y259 395 aa22.91■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 RAI2Q9Y5P3 530 aa22.91■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 GSRP00390 522 aa22.9■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 HLA-DPA1P20036 260 aa22.9■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 PHBP35232 272 aa22.9■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 ZNF844Q08AG5 666 aa22.9■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 TRAF2Q12933 501 aa22.9■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 UNC5AQ6ZN44 842 aa22.9■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 CCNJLQ8IV13 435 aa22.9■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 OR6K2Q8NGY2 324 aa22.9■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 RUFY1Q96T51 708 aa22.9■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 SAMD15Q9P1V8 674 aa22.9■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 LIMD1Q9UGP4 676 aa22.9■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 TIMM44O43615 452 aa22.89■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 NDST3O95803 873 aa22.89■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 PRLP01236 227 aa22.89■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 PGAM1P18669 254 aa22.89■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 NNMTP40261 264 aa22.89■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 MAPK8P45983 427 aa22.89■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 IFFO1Q0D2I5 559 aa22.89■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 LEXMQ3ZCV2 418 aa22.89■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 STEAP4Q687X5 459 aa22.89■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 SFTPA1Q8IWL2 248 aa22.89■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa22.89■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 FRS2Q8WU20 508 aa22.89■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 KCNK12Q9HB15 430 aa22.89■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 SPAG6O75602 509 aa22.89■■□□□ 1.25
UFD1-201ENST00000263202 GSTA2P09210 222 aa22.89■■□□□ 1.25
UFD1-201ENST00000263202 SOX9P48436 509 aa22.89■■□□□ 1.25
UFD1-201ENST00000263202 GALNT3Q14435 633 aa22.89■■□□□ 1.25
UFD1-201ENST00000263202 POU6F1Q14863 301 aa22.89■■□□□ 1.25
UFD1-201ENST00000263202 CARD16Q5EG05 197 aa22.89■■□□□ 1.25
UFD1-201ENST00000263202 VOPP1Q96AW1 172 aa22.89■■□□□ 1.25
UFD1-201ENST00000263202 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
UFD1-201ENST00000263202 MAGEB16A2A368 324 aa22.88■■□□□ 1.25
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UFD1-201ENST00000263202 FGF1P05230 155 aa22.88■■□□□ 1.25
UFD1-201ENST00000263202 PDHA1P08559 390 aa22.88■■□□□ 1.25
UFD1-201ENST00000263202 GKP32189 559 aa22.88■■□□□ 1.25
UFD1-201ENST00000263202 PCID2Q5JVF3 399 aa22.88■■□□□ 1.25
UFD1-201ENST00000263202 CEP85LQ5SZL2 805 aa22.88■■□□□ 1.25
UFD1-201ENST00000263202 Q6ZVU0 165 aa22.88■■□□□ 1.25
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UFD1-201ENST00000263202 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
UFD1-201ENST00000263202 SLC44A3Q8N4M1 653 aa22.88■■□□□ 1.25
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UFD1-201ENST00000263202 RABGEF1Q9UJ41 708 aa22.88■■□□□ 1.25
UFD1-201ENST00000263202 SOX13Q9UN79 622 aa22.88■■□□□ 1.25
UFD1-201ENST00000263202 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa22.87■■□□□ 1.25
UFD1-201ENST00000263202 TBC1D3BA6NDS4 549 aa22.87■■□□□ 1.25
UFD1-201ENST00000263202 KAT7O95251 611 aa22.87■■□□□ 1.25
UFD1-201ENST00000263202 STAT4Q14765 748 aa22.87■■□□□ 1.25
UFD1-201ENST00000263202 MYLK3Q32MK0 819 aa22.87■■□□□ 1.25
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UFD1-201ENST00000263202 GSDMBQ8TAX9 411 aa22.87■■□□□ 1.25
UFD1-201ENST00000263202 TMEM109Q9BVC6 243 aa22.87■■□□□ 1.25
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UFD1-201ENST00000263202 CHRAC1Q9NRG0 131 aa22.87■■□□□ 1.25
UFD1-201ENST00000263202 PLA2G4CQ9UP65 541 aa22.87■■□□□ 1.25
UFD1-201ENST00000263202 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa22.87■■□□□ 1.25
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UFD1-201ENST00000263202 BCL2L1Q07817 233 aa22.87■■□□□ 1.25
UFD1-201ENST00000263202 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
UFD1-201ENST00000263202 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa22.87■■□□□ 1.25
UFD1-201ENST00000263202 OR2A12Q8NGT7 310 aa22.87■■□□□ 1.25
UFD1-201ENST00000263202 SH3GL2Q99962 352 aa22.87■■□□□ 1.25
UFD1-201ENST00000263202 TRPV5Q9NQA5 729 aa22.87■■□□□ 1.25
UFD1-201ENST00000263202 SLC8A2Q9UPR5 921 aa22.87■■□□□ 1.25
UFD1-201ENST00000263202 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
UFD1-201ENST00000263202 POLBP06746 335 aa22.86■■□□□ 1.25
UFD1-201ENST00000263202 ALADP13716 330 aa22.86■■□□□ 1.25
UFD1-201ENST00000263202 GRIA2P42262 883 aa22.86■■□□□ 1.25
UFD1-201ENST00000263202 CRYMQ14894 314 aa22.86■■□□□ 1.25
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