RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc13D3YV10 709 aa11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ism2D3Z6A3 493 aa11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm20431E9PY39 371 aa11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rc3h2P0C090 1187 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pdcd2P46718 343 aa11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 St14P56677 855 aa11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Eif4ebp2P70445 120 aa11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 SpertQ32MG2 446 aa11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr464Q5SW48 313 aa11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Phc1Q64028 1012 aa11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lingo3Q6GQU6 589 aa11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dsg1bQ7TSF1 1060 aa11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rimbp2Q80U40 1072 aa11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Insig1Q8BGI3 259 aa11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc39a13Q8BZH0 361 aa11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc63Q8CDV6 558 aa11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sh3kbp1Q8R550 709 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mark1Q8VHJ5 795 aa11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mlc1Q8VHK5 382 aa11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lpgat1Q91YX5 370 aa11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mxra7Q9CZH7 178 aa11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Copg2Q9QXK3 871 aa11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Clec4aQ9QZ15 238 aa11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pla2g2fQ9QZT4 168 aa11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ddx39bQ9Z1N5 428 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dio2Q9Z1Y9 266 aa11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Myo18aQ9JMH9 2050 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arhgef37A1IGU4 676 aa11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc149F6V035 524 aa11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 RargP18911 458 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pou5f1P20263 352 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dbx1P52950 335 aa11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mrps6P58064 125 aa11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fgf13P70377 245 aa11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nfe2l1Q61985 741 aa11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cttnbp2nlQ99LJ0 638 aa11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 LiasQ99M04 373 aa11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zmynd10Q99ML0 440 aa11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nt5c3aQ9D020 331 aa11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ten1Q9D7K2 161 aa11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Plscr2Q9DCW2 307 aa11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Spry1Q9QXV9 313 aa11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ap4b1Q9WV76 738 aa11.89□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ptger3P30557 365 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ripk2P58801 539 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 UtyP79457 1212 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc17a7Q3TXX4 560 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zmym5Q3U2E2 627 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ppp1r7Q3UM45 361 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Otol1Q4ZJM7 482 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Naif1Q6PFD7 327 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dyrk4Q8BI55 632 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q8BWG4 1187 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Abi3Q8BYZ1 367 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lrrc19Q8BZT5 364 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Washc5Q8C2E7 1159 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 DlstQ9D2G2 454 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nsmce1Q9D720 266 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam83dQ9D7I8 585 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 GgcxQ9QYC7 757 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cep85lA0A1W2P884 806 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 PfklP12382 780 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Irx2P81066 474 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gpatch4Q3TFK5 415 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nat9Q3UG98 241 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q3V0E1 1183 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q6GQU0 248 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 AtminQ6P9S1 818 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Msantd1Q8BIL2 278 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tbc1d17Q8BYH7 645 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q8C4P0 716 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rtn4rl1Q8K0S5 445 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 PdiltQ9DAN1 588 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sema4fQ9Z123 777 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gbf1Q6DFZ1 1861 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr742A2RTP5 311 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ttll11A4Q9F4 727 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ddx43D3Z6P9 646 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 P01810 119 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 PolP11369 1281 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ca3P16015 260 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wee1P47810 646 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ybx1P62960 322 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arf5P84084 180 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem255bQ5FW56 369 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ppp1r13lQ5I1X5 824 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 CcnhQ61458 323 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trim24Q64127 1051 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atp2a3Q64518 1038 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nemp1Q6ZQE4 437 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr1062Q7TR71 315 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr366Q7TRY4 309 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pcdha6Q91Y14 946 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tcf7l2Q924A0 459 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Commd8Q9CZG3 183 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 4930524N10RikQ9D519 233 aa11.88□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rpl21O09167 160 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ifnar2O35664 513 aa11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Grk4O70291 574 aa11.87□□□□□ -0.51
Herc3-201ENSMUST00000031823 Srpk1O70551 648 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 60.8 ms