RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026252.13

Ldb1-201, Transcript of LIM domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ldb1, Length 1,718 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Dok4Q99KE3 325 aa19.11■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ly6kQ9CWP4 154 aa19.11■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 NfkbizQ9EST8 728 aa19.11■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ttll11A4Q9F4 727 aa19.1■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Yme1l1O88967 715 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 H2-Eb1P04230 264 aa19.1■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 CremP27699 357 aa19.1■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 AurkaP97477 395 aa19.1■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Zfp217Q3U0X6 1041 aa19.1■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Bdkrb1Q61125 334 aa19.1■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ggnbp1Q6K1E7 370 aa19.1■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Rps6kc1Q8BLK9 1056 aa19.1■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Aldh4a1Q8CHT0 562 aa19.1■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Nudcd3Q8R1N4 363 aa19.1■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ubap2Q91VX2 1132 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Snx15Q91WE1 337 aa19.1■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 SardhQ99LB7 919 aa19.1■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Actrt2Q9D9L5 377 aa19.1■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 CasrQ9QY96 1079 aa19.1■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Shroom3Q9QXN0 1986 aa19.1■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tmem240B2RWJ3 173 aa19.09■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Capn2O08529 700 aa19.09■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Sult1e1P49891 295 aa19.09■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 NcanP55066 1268 aa19.09■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gm853Q3UNZ2 425 aa19.09■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 ADGRF3Q58Y75 991 aa19.09■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Arcn1Q5XJY5 511 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cntn4Q69Z26 1026 aa19.09■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Sort1Q6PHU5 825 aa19.09■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Paqr6Q6TCG5 343 aa19.09■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Nemp1Q6ZQE4 437 aa19.09■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cep104Q80V31 926 aa19.09■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Atg16l1Q8C0J2 607 aa19.09■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Pcyox1lQ8C7K6 495 aa19.09■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Hacd3Q8K2C9 362 aa19.09■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Dlg2Q91XM9 852 aa19.09■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tceal1Q921P9 165 aa19.09■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gtf2ird2Q99NI3 936 aa19.09■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Themis3Q9CU24 569 aa19.09■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mfsd10Q9D2V8 456 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 RhojQ9ER71 214 aa19.09■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Oaz3Q9R109 243 aa19.09■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Myo1cQ9WTI7 1063 aa19.09■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Slc23a4A0A0J9YUX7 615 aa19.08■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 4930444G20RikD3Z741 495 aa19.08■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Per3O70361 1113 aa19.08■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Upp1P52624 311 aa19.08■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ctnnb1Q02248 781 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Lrriq3Q14DL3 633 aa19.08■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Fam35aQ3UEN2 891 aa19.08■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Prss53Q571E5 552 aa19.08■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 ScinQ60604 715 aa19.08■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Foxd4Q60688 444 aa19.08■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 AtminQ6P9S1 818 aa19.08■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Galnt10Q6P9S7 603 aa19.08■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Prr18Q6PAN7 307 aa19.08■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 C5ar2Q8BW93 344 aa19.08■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mtrf1Q8K126 446 aa19.08■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Abcf3Q8K268 709 aa19.08■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Champ1Q8K327 802 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Nmnat1Q9EPA7 285 aa19.08■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 PrebQ9WUQ2 417 aa19.08■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Htatip2Q9Z2G9 242 aa19.08■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 H2afb2S4R1M3 115 aa19.08■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 RlfA2A7F4 1918 aa19.08■□□□□ 0.65
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cilp2D3Z7H8 1162 aa19.08■□□□□ 0.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Vmn1r176G3UW31 304 aa19.08■□□□□ 0.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gm6408J3QNG1 320 aa19.08■□□□□ 0.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gm3402K7N5P2 326 aa19.08■□□□□ 0.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Psmc3O88685 442 aa19.08■□□□□ 0.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Dnmt3cP0DOY1 709 aa19.08■□□□□ 0.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cd9P40240 226 aa19.08■□□□□ 0.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 AdprhP54923 362 aa19.08■□□□□ 0.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cd300lgQ1ERP8 331 aa19.08■□□□□ 0.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Meaf6Q2VPQ9 191 aa19.08■□□□□ 0.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Hbq1bQ3U0A6 142 aa19.08■□□□□ 0.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Epb41l5Q8BGS1 731 aa19.08■□□□□ 0.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Znf879Q8BI99 563 aa19.08■□□□□ 0.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ptk7Q8BKG3 1062 aa19.08■□□□□ 0.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Trim14Q8BVW3 440 aa19.08■□□□□ 0.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Hdac7Q8C2B3 938 aa19.08■□□□□ 0.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tbc1d14Q8CGA2 694 aa19.08■□□□□ 0.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Trip10Q8CJ53 603 aa19.08■□□□□ 0.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 MfrpQ8K480 584 aa19.08■□□□□ 0.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Vmn1r18Q8R2C8 299 aa19.08■□□□□ 0.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ppil6Q9D6D8 278 aa19.08■□□□□ 0.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Smg9Q9DB90 520 aa19.08■□□□□ 0.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cyp3a41aQ9JMA7 504 aa19.08■□□□□ 0.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 NagaQ9QWR8 415 aa19.08■□□□□ 0.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Fam166bA2AIP0 273 aa19.07■□□□□ 0.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ttc23lA6H6E9 458 aa19.07■□□□□ 0.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Nsmce4aG3XA30 381 aa19.07■□□□□ 0.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 SagP20443 403 aa19.07■□□□□ 0.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ssx9Q6XAS3 170 aa19.07■□□□□ 0.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Clptm1lQ8BXA5 539 aa19.07■□□□□ 0.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Rab44Q8CB87 725 aa19.07■□□□□ 0.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Sirt5Q8K2C6 310 aa19.07■□□□□ 0.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Rbm12Q8R4X3 992 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Adam33Q923W9 797 aa19.07■□□□□ 0.64
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Grm3Q9QYS2 879 aa19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 49.9 ms