RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 SCUBE2Q9NQ36 999 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 MIA3Q5JRA6 1907 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 MAGEB16A2A368 324 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 EPOP01588 193 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 IVLP07476 585 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 CISD3P0C7P0 127 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 OAS2P29728 719 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 CHRNA4P43681 627 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 RHOAP61586 193 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC1A5Q15758 541 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 AHI1Q8N157 1196 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 GSDMBQ8TAX9 411 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 SAMD15Q9P1V8 674 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 FETUBQ9UGM5 382 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 HS3ST2Q9Y278 367 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 SZT2Q5T011 3432 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 TLDC2A0PJX2 215 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM24O15164 1050 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP9BO43861 1147 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 C1QAP02745 245 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 STX2P32856 288 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 SLCO1A2P46721 670 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 SULT2A1Q06520 285 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 CDK18Q07002 472 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 GAB4Q2WGN9 574 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 RALGPS1Q5JS13 557 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 CYS1Q717R9 158 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF135Q8IUD6 432 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 PGM2Q96G03 612 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 NECTIN4Q96NY8 510 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 ECT2Q9H8V3 914 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 HPS4Q9NQG7 708 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 SMIM23A6NLE4 172 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF40O75150 1001 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 SRCP12931 536 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 GCAP28676 217 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 DGKGP49619 791 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 KLHL38Q2WGJ6 581 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM215Q68D42 235 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 NCEH1Q6PIU2 408 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 PARM1Q6UWI2 310 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM135Q86UB9 458 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 C12orf40Q86WS4 652 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 MICALL1Q8N3F8 863 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC25A41Q8N5S1 370 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 SUSD6Q92537 303 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 TTC17Q96AE7 1141 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 IFT43Q96FT9 208 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIB3Q96RU7 358 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 CYTH2Q99418 400 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 CENPHQ9H3R5 247 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 PPCSQ9HAB8 311 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 SOX13Q9UN79 622 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 ALDH1A2O94788 518 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 POLBP06746 335 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 PSMC3P17980 439 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 PRKCHP24723 683 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 STK19P49842 368 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 CRYMQ14894 314 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 GEN1Q17RS7 908 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 PCID2Q5JVF3 399 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 SIRPB2Q5JXA9 342 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 AGBL2Q5U5Z8 902 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 MBLAC2Q68D91 279 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 TDRPQ86YL5 185 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 SH2D3CQ8N5H7 860 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 FGF14Q92915 247 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM161BQ96MY7 647 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 KXD1Q9BQD3 176 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 KIFC1Q9BW19 673 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 EURLQ9NYK6 297 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 MOCS1Q9NZB8 636 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC25A13Q9UJS0 675 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 TULP3O75386 442 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 USP1O94782 785 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 HLA-DPA1P20036 260 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 CSNK1DP48730 415 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 ECT2LQ008S8 904 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 SPANXN3Q5MJ09 141 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 ARMC3Q5W041 872 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 SRLQ86TD4 932 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC24A2Q9UI40 661 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 CD207Q9UJ71 328 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-215ENST00000628018 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa25.15■■□□□ 1.62
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