RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617649.4

ACACA-240, Transcript of acetyl-CoA carboxylase alpha, human

TSL 5 BASIC

Gene ACACA, Length 7,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACACA-240	ENST00000617649		A0A1W2PQH9	124 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	ARVCF	O00192	962 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	CCL5	P13501	91 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	RBL1	P28749	1068 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	TRIM60	Q495X7	471 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	AGK	Q53H12	422 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	SRRD	Q9UH36	339 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649		A8MX80	341 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	RIPK2	O43353	540 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	TSPAN1	O60635	241 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	KRT33A	O76009	404 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	C1R	P00736	705 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	PSMD8	P48556	350 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	DLG4	P78352	724 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	UBE3A	Q05086	875 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	TAF10	Q12962	218 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	TAF13	Q15543	124 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	CHST9	Q7L1S5	443 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	THAP11	Q96EK4	314 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649		A0A0B4J269	797 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	KRT34	O76011	436 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	CCDC159	P0C7I6	412 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	VAV1	P15498	845 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	CDH4	P55283	916 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	LRRC32	Q14392	662 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	UGCG	Q16739	394 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	C11orf88	Q6PI97	169 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	COMMD2	Q86X83	199 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	SNX27	Q96L92	541 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	SLITRK2	Q9H156	845 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	OTC	P00480	354 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	ATP6V1B2	P21281	511 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	AKT2	P31751	481 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	VAC14	Q08AM6	782 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	ST3GAL1	Q11201	340 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	TRAF2	Q12933	501 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	GPM6B	Q13491	265 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	RASA2	Q15283	850 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	ADRM1	Q16186	407 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	XKR4	Q5GH76	650 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	CERS2	Q96G23	380 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	COPS8	Q99627	209 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	AP4S1	Q9Y587	144 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649		A0A1B0GVM2	712 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	ABL2	P42684	1182 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	POLD2	P49005	469 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	MAPKAPK2	P49137	400 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	NEK3	P51956	506 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	ACLY	P53396	1101 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	CYP4X1	Q8N118	509 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ACACA-240	ENST00000617649	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		6.67	□□□□□ -1.34

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