RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614197.4

NPIPB4-222, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 5 BASIC

Gene NPIPB4, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-222	ENST00000614197	CACNA1E	Q15878	2313 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	C10orf142	B7Z368	130 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	SDC3	O75056	442 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	PALM	O75781	387 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	TM7SF2	O76062	418 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	NFKBIA	P25963	317 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	GK	P32189	559 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	CLDN2	P57739	230 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	FANCC	Q00597	558 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	E2F1	Q01094	437 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	PTK2B	Q14289	1009 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	NR1I3	Q14994	352 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	ACAP1	Q15027	740 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	SHB	Q15464	509 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	PARG	Q86W56	976 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	BBS5	Q8N3I7	341 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	LZTR1	Q8N653	840 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	ASB12	Q8WXK4	309 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	CBX8	Q9HC52	389 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	NUMA1	Q14980	2115 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197		A0A1W2PQJ5	194 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	IGLON5	A6NGN9	336 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	DFFA	O00273	331 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	FFAR2	O15552	330 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	CD160	O95971	181 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	SERPING1	P05155	500 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	TPM1	P09493	284 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	SKIL	P12757	684 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	DGKA	P23743	735 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	SERPINA4	P29622	427 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	MIP	P30301	263 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	RENBP	P51606	427 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZBED6	P86452	979 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	OGDH	Q02218	1023 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	DNAJC3	Q13217	504 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	IQCB1	Q15051	598 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	BOLA3	Q53S33	107 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	RFX8	Q6ZV50	586 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	LUZP1	Q86V48	1076 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	ATL2	Q8NHH9	583 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	SYT11	Q9BT88	431 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	DKK3	Q9UBP4	350 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	NEU3	Q9UQ49	428 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	11.1	□□□□□ -0.63	1e-7	■■■□□ 15.2
NPIPB4-222	ENST00000614197	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	11.09	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	TOR1B	O14657	336 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	PRAMEF11	O60813	436 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	PIAS2	O75928	621 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	DKK1	O94907	266 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	HTR1B	P28222	390 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	PCK1	P35558	622 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	ABL2	P42684	1182 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	HCAR3	P49019	387 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	ACADVL	P49748	655 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NPIPB4-222	ENST00000614197	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63

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