RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611636.4

WHAMMP3-201, Transcript of WAS protein homolog associated with actin, golgi membranes and microtubules pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene WHAMMP3, Length 1,609 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMP3-201ENST00000611636 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 CCDC25Q86WR0 208 aa25.18■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 UCMAQ8WVF2 138 aa25.18■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 TADA1Q96BN2 335 aa25.18■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 FSD1LQ9BXM9 530 aa25.18■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 PIAS3Q9Y6X2 628 aa25.18■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 NARSO43776 548 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 ATP9BO43861 1147 aa25.17■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 IGSF6O95976 241 aa25.17■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 GALK1P51570 392 aa25.17■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 WNT3AP56704 352 aa25.17■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 RALGPS1Q5JS13 557 aa25.17■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa25.17■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 KDELC1Q6UW63 502 aa25.17■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 CEP128Q6ZU80 1094 aa25.17■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 SFTPA1Q8IWL2 248 aa25.17■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 PDIK1LQ8N165 341 aa25.17■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa25.17■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 SERPINB12Q96P63 405 aa25.17■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 TNKS2Q9H2K2 1166 aa25.17■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 HEBP1Q9NRV9 189 aa25.17■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 F5P12259 2224 aa25.16■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 PPFIA2O75334 1257 aa25.16■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 SRFP11831 508 aa25.16■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 CSNK1DP48730 415 aa25.16■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 IHHQ14623 411 aa25.16■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 SLC14A2Q15849 920 aa25.16■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 PCSK7Q16549 785 aa25.16■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 CENPUQ71F23 418 aa25.16■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 SRLQ86TD4 932 aa25.16■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 LINC00523Q86TU6 105 aa25.16■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 OR2AP1Q8NGE2 309 aa25.16■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 CAVIN3Q969G5 261 aa25.16■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 MRGPRX2Q96LB1 330 aa25.16■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 CD320Q9NPF0 282 aa25.16■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 USP12O75317 370 aa25.15■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 GSRP00390 522 aa25.15■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 GRIA1P42261 906 aa25.15■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 FNBP1LQ5T0N5 605 aa25.15■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 MYO19Q96H55 970 aa25.15■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 TBL1YQ9BQ87 522 aa25.15■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 FICDQ9BVA6 458 aa25.15■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 VIPAS39Q9H9C1 493 aa25.15■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa25.15■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 MLNP12872 115 aa25.15■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 MAPK8P45983 427 aa25.15■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 AP1S1P61966 158 aa25.15■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 OLIG2Q13516 323 aa25.15■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 SLMAPQ14BN4 828 aa25.15■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 LRRC8BQ6P9F7 803 aa25.15■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 NCEH1Q6PIU2 408 aa25.15■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 TXNDC11Q6PKC3 985 aa25.15■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 ZNF534Q76KX8 674 aa25.15■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 KDM1BQ8NB78 822 aa25.15■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 APOL2Q9BQE5 337 aa25.15■■□□□ 1.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 TTC34A8MYJ7 566 aa25.14■■□□□ 1.61
WHAMMP3-201ENST00000611636 AGTP01019 485 aa25.14■■□□□ 1.61
WHAMMP3-201ENST00000611636 GLULP15104 373 aa25.14■■□□□ 1.61
WHAMMP3-201ENST00000611636 ADRA1AP35348 466 aa25.14■■□□□ 1.61
WHAMMP3-201ENST00000611636 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
WHAMMP3-201ENST00000611636 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
WHAMMP3-201ENST00000611636 CARD16Q5EG05 197 aa25.14■■□□□ 1.61
WHAMMP3-201ENST00000611636 Q6ZVU0 165 aa25.14■■□□□ 1.61
WHAMMP3-201ENST00000611636 KDELC2Q7Z4H8 507 aa25.14■■□□□ 1.61
WHAMMP3-201ENST00000611636 OR52K1Q8NGK4 314 aa25.14■■□□□ 1.61
WHAMMP3-201ENST00000611636 FRS2Q8WU20 508 aa25.14■■□□□ 1.61
WHAMMP3-201ENST00000611636 IFT43Q96FT9 208 aa25.14■■□□□ 1.61
WHAMMP3-201ENST00000611636 PHACTR1Q9C0D0 580 aa25.14■■□□□ 1.61
WHAMMP3-201ENST00000611636 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
WHAMMP3-201ENST00000611636 BNIP3LO60238 219 aa25.13■■□□□ 1.61
WHAMMP3-201ENST00000611636 AVILO75366 819 aa25.13■■□□□ 1.61
WHAMMP3-201ENST00000611636 TNFRSF4P43489 277 aa25.13■■□□□ 1.61
WHAMMP3-201ENST00000611636 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
WHAMMP3-201ENST00000611636 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
WHAMMP3-201ENST00000611636 MTM1Q13496 603 aa25.13■■□□□ 1.61
WHAMMP3-201ENST00000611636 BBS9Q3SYG4 887 aa25.13■■□□□ 1.61
WHAMMP3-201ENST00000611636 TMC3Q7Z5M5 1100 aa25.13■■□□□ 1.61
WHAMMP3-201ENST00000611636 PLPP6Q8IY26 295 aa25.13■■□□□ 1.61
WHAMMP3-201ENST00000611636 DNAAF3Q8N9W5 541 aa25.13■■□□□ 1.61
WHAMMP3-201ENST00000611636 OR6K2Q8NGY2 324 aa25.13■■□□□ 1.61
WHAMMP3-201ENST00000611636 NSMCE3Q96MG7 304 aa25.13■■□□□ 1.61
WHAMMP3-201ENST00000611636 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
WHAMMP3-201ENST00000611636 SAYSD1Q9NPB0 183 aa25.13■■□□□ 1.61
WHAMMP3-201ENST00000611636 CASS4Q9NQ75 786 aa25.13■■□□□ 1.61
WHAMMP3-201ENST00000611636 AP3B1O00203 1094 aa25.12■■□□□ 1.61
WHAMMP3-201ENST00000611636 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.61
WHAMMP3-201ENST00000611636 CA4P22748 312 aa25.12■■□□□ 1.61
WHAMMP3-201ENST00000611636 CDK18Q07002 472 aa25.12■■□□□ 1.61
WHAMMP3-201ENST00000611636 CDH17Q12864 832 aa25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms