RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 TCEAL4Q96EI5 215 aa29.45■■■□□ 2.3
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CTDNEP1-208ENST00000573600 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC17A6Q9P2U8 582 aa29.45■■■□□ 2.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 PSAT1Q9Y617 370 aa29.45■■■□□ 2.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 COPEO14579 308 aa29.44■■■□□ 2.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 DRD4P21917 467 aa29.44■■■□□ 2.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPRP35270 261 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 NUMBP49757 651 aa29.44■■■□□ 2.3
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SH3RF2Q8TEC5 729 aa29.44■■■□□ 2.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF778Q96MU6 729 aa29.44■■■□□ 2.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 VPS28Q9UK41 221 aa29.44■■■□□ 2.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR51B4Q9Y5P0 310 aa29.44■■■□□ 2.3
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ITGA2BP08514 1039 aa29.43■■■□□ 2.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 CR2P20023 1033 aa29.43■■■□□ 2.3
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CTDNEP1-208ENST00000573600 DCAF4L2Q8NA75 395 aa29.43■■■□□ 2.3
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CTDNEP1-208ENST00000573600 INSIG1O15503 277 aa29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SEPT6Q14141 434 aa29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 NLRP9Q7RTR0 991 aa29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 STRA8Q7Z7C7 330 aa29.42■■■□□ 2.3
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CTDNEP1-208ENST00000573600 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRSS36Q5K4E3 855 aa29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 FYB2Q5VWT5 728 aa29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 RNF43Q68DV7 783 aa29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 ALG14Q96F25 216 aa29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 NUDCD1Q96RS6 583 aa29.42■■■□□ 2.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 AGAP2Q99490 1192 aa29.42■■■□□ 2.3
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ALADP13716 330 aa29.4■■■□□ 2.3
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CTDNEP1-208ENST00000573600 LIMK2P53671 638 aa29.4■■■□□ 2.3
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC5A9Q2M3M2 681 aa29.4■■■□□ 2.3
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CTDNEP1-208ENST00000573600 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa29.4■■■□□ 2.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 NOTCH4Q99466 2003 aa29.4■■■□□ 2.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCDC78A2IDD5 438 aa29.4■■■□□ 2.3
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CTDNEP1-208ENST00000573600 TIMM44O43615 452 aa29.4■■■□□ 2.3
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CTDNEP1-208ENST00000573600 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
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CTDNEP1-208ENST00000573600 VAPBO95292 243 aa29.39■■■□□ 2.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 CRHR1P34998 444 aa29.39■■■□□ 2.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 CNGA3Q16281 694 aa29.39■■■□□ 2.3
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