RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562011.1

CTU2-203, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTU2, Length 324 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-203ENST00000562011 VCPIP1Q96JH7 1222 aa14.53□□□□□ -0.08
CTU2-203ENST00000562011 KLHL32Q96NJ5 620 aa14.53□□□□□ -0.08
CTU2-203ENST00000562011 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CTU2-203ENST00000562011 DUSP23Q9BVJ7 150 aa14.53□□□□□ -0.08
CTU2-203ENST00000562011 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CTU2-203ENST00000562011 F8VZ95 297 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 MUSKO15146 869 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 LSM8O95777 96 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 PLA2G2AP14555 144 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 CHRNB2P17787 502 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 IGFALSP35858 605 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 KLK7P49862 253 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 UBE2HP62256 183 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 ZNF805Q5CZA5 627 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 SMYD5Q6GMV2 418 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 VPS36Q86VN1 386 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 CCDC185Q8N715 623 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 OR2AP1Q8NGE2 309 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 CENPTQ96BT3 561 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 SEMA4CQ9C0C4 833 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 CLPBQ9H078 707 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 KLC2Q9H0B6 622 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 H3BM21 787 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 NEMP1O14524 444 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 AREL1O15033 823 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 KLK10O43240 276 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 TSPAN6O43657 245 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 MMP20O60882 483 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 GFPT2O94808 682 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 LRIG2O94898 1065 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 RHOQP17081 205 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 ADKP55263 362 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 FMO1Q01740 532 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 CFHR1Q03591 330 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 TCEA2Q15560 299 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 MYLK3Q32MK0 819 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 PRRT3Q5FWE3 981 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 FOXR1Q6PIV2 292 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 ARCQ7LC44 396 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 FAM114A1Q8IWE2 563 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 SLC35F3Q8IY50 421 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 PYROXD2Q8N2H3 581 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 KCNE4Q8WWG9 221 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 IL12RB2Q99665 862 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 C11orf70Q9BRQ4 267 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 LRRC61Q9BV99 259 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 STK33Q9BYT3 514 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 GANQ9H2C0 597 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 USP29Q9HBJ7 922 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 TMEM248Q9NWD8 314 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 TAB2Q9NYJ8 693 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 ZNF462Q96JM2 2506 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 LRP4O75096 1905 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 C2CD4BA6NLJ0 364 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 EPHB6O15197 1021 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 GSRP00390 522 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 KRT10P13645 584 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 MAPKAPK2P49137 400 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 PDX1P52945 283 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 HDAC4P56524 1084 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 TMPRSS3P57727 454 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 ERVPABLB-1P60509 514 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 LY6DQ14210 128 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 ZNF605Q86T29 641 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 PLPP6Q8IY26 295 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 PHACTR4Q8IZ21 702 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 LSMEM2Q8N112 164 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 ASB12Q8WXK4 309 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 PCDHB18PQ96TA0 734 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 BOCQ9BWV1 1114 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 CLSTN2Q9H4D0 955 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 SALL4Q9UJQ4 1053 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 COQ6Q9Y2Z9 468 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 ANKRD36A6QL64 1941 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 ERVH48-1M5A8F1 160 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 INSIG1O15503 277 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 KDELR3O43731 214 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 TMCC1O94876 653 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 POP4O95707 220 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 TIMP2P16035 220 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 TSHRP16473 764 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 MMP8P22894 467 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 THOP1P52888 689 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms