RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558341.5

PSMA4-206, Transcript of proteasome subunit alpha 4, human

TSL 5 BASIC

Gene PSMA4, Length 719 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA4-206	ENST00000558341	LPIN1	Q14693	890 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	NFIL3	Q16649	462 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	NEUROG1	Q92886	237 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	RNF183	Q96D59	192 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	EVPL	Q92817	2033 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	LACTBL1	A8MY62	500 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	TEX22	C9J3V5	150 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	CHL1	O00533	1208 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	EBAG9	O00559	213 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	ASAP2	O43150	1006 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	T-ENOL	P0DO92	83 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	PLA2G2A	P14555	144 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	RYK	P34925	604 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	LIFR	P42702	1097 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	GPD2	P43304	727 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	NUDT6	P53370	316 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	LTB	Q06643	244 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	CKAP5	Q14008	2032 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	SHB	Q15464	509 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	ZNF766	Q5HY98	468 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	PLD5	Q8N7P1	536 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	ELP5	Q8TE02	316 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	PHF21B	Q96EK2	531 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	CDT1	Q9H211	546 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	PEMT	Q9UBM1	199 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-206	ENST00000558341	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	ITM2A	O43736	263 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	SLC28A2	O43868	658 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	GUCY1B2	O75343	617 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	UROD	P06132	367 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	TNFRSF8	P28908	595 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	AMT	P48728	403 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	CLCN5	P51795	746 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	CDH15	P55291	814 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	VAMP2	P63027	116 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	ZXDB	P98169	803 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	CYP4A11	Q02928	519 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	EGR4	Q05215	589 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	TRPC3	Q13507	836 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	PDXDC1	Q6P996	788 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	FAM160B2	Q86V87	743 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	GLUD1	P00367	558 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	SRD5A1	P18405	259 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	GLUD2	P49448	558 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	EFNB1	P98172	346 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	DSC1	Q08554	894 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	SLC22A25	Q6T423	547 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	HTRA1	Q92743	480 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	HVCN1	Q96D96	273 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	FUZ	Q9BT04	418 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	TMEM51	Q9NW97	253 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	WNT16	Q9UBV4	365 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA4-206	ENST00000558341	GJD2	Q9UKL4	321 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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