RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555905.5

TMEM260-208, Transcript of transmembrane protein 260, human

TSL 5

Gene TMEM260, Length 766 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM260-208	ENST00000555905	RAD51	Q06609	339 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	ZNF234	Q14588	700 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	CARD16	Q5EG05	197 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	LINC00523	Q86TU6	105 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	RNF135	Q8IUD6	432 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	PLPP6	Q8IY26	295 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	MCU	Q8NE86	351 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	IPMK	Q8NFU5	416 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	FAM3C	Q92520	227 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	IFT43	Q96FT9	208 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	NOD2	Q9HC29	1040 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	RAB21	Q9UL25	225 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	NFU1	Q9UMS0	254 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905		K7EQS6	105 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	BNIP3L	O60238	219 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	ERLIN1	O75477	346 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	GJB3	O75712	270 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	SUN1	O94901	812 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	EGF	P01133	1207 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	MMP2	P08253	660 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	BMP1	P13497	986 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	SEC13	P55735	322 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	WNT3A	P56704	352 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	PRKCQ	Q04759	706 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	GRM3	Q14832	879 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	PCSK7	Q16549	785 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	MYLK3	Q32MK0	819 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	MAP9	Q49MG5	647 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	KCTD11	Q693B1	232 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	SDE2	Q6IQ49	451 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905		Q6ZVU0	165 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	FRS2	Q8WU20	508 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	TADA1	Q96BN2	335 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	MYO19	Q96H55	970 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	SHD	Q96IW2	340 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	FMO2	Q99518	471 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	FICD	Q9BVA6	458 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	WNT16	Q9UBV4	365 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	SUN2	Q9UH99	717 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	CA14	Q9ULX7	337 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	TP73	O15350	636 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	PPFIA2	O75334	1257 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	TMEM63A	O94886	807 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TMEM260-208	ENST00000555905	MLN	P12872	115 aa		11.15	□□□□□ -0.62

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