RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 ING2Q9H160 280 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 TUBB1Q9H4B7 451 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 CATSPERZQ9NTU4 200 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 MCUBQ9NWR8 336 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 GLS2Q9UI32 602 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 BAG5Q9UL15 447 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 ASB3Q9Y575 518 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 I3L521 148 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 FKBP9O95302 570 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 PGK1P00558 417 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 ITGB1P05556 798 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 PSMC3P17980 439 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 DNAJB1P25685 340 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 NMT1P30419 496 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 RRM2P31350 389 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 CCL23P55773 120 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 TGM3Q08188 693 aa6.37□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 LSAMPQ13449 338 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 GPM6BQ13491 265 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 TTLL9Q3SXZ7 439 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 TCP11X2Q5H9J9 407 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 PMF1Q6P1K2 205 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 POMZP3Q6PJE2 187 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 RHOT1Q8IXI2 618 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 PDIK1LQ8N165 341 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 HDAC11Q96DB2 347 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 SYT15Q9BQS2 421 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 NUP85Q9BW27 656 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 NWD2Q9ULI1 1742 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 MYO5BQ9ULV0 1848 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 SHPRHQ149N8 1683 aa6.37□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 GPR89AB7ZAQ6 455 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 DCXO43602 365 aa6.37□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 GPR89BP0CG08 455 aa6.37□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 ICAM3P32942 547 aa6.37□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 RGS4P49798 205 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 BCAR1P56945 870 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 GRM3Q14832 879 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 TBCCQ15814 346 aa6.37□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 LY6KQ17RY6 165 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 AAGABQ6PD74 315 aa6.37□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 ZNF227Q86WZ6 799 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 SPPL2BQ8TCT7 592 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 ZBTB18Q99592 522 aa6.37□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 TMEM175Q9BSA9 504 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 DESI2Q9BSY9 194 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 ABCB10Q9NRK6 738 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 KBTBD4Q9NVX7 518 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 RAB21Q9UL25 225 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 PODXLO00592 558 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 TP73O15350 636 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 PKLRP30613 574 aa6.36□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 BEX3Q00994 111 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 CDK18Q07002 472 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 NME3Q13232 169 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
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PTPRB-210ENST00000551525 LRIT3Q3SXY7 679 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 UGT3A1Q6NUS8 523 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 RGL4Q8IZJ4 473 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 TTC8Q8TAM2 541 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-210ENST00000551525 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa6.36□□□□□ -1.39
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