RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 MXI1P50539 228 aa5.07□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 DDR1Q08345 913 aa5.07□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP5.07□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 NCAPH2Q6IBW4 605 aa5.07□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 AADACL2Q6P093 401 aa5.07□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 RAB11FIP2Q7L804 512 aa5.07□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 DEPTORQ8TB45 409 aa5.07□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 ARRDC3Q96B67 414 aa5.07□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 CCDC136Q96JN2 1154 aa5.07□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 MYD88Q99836 296 aa5.07□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 LHPPQ9H008 270 aa5.07□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 BAG5Q9UL15 447 aa5.07□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 PHTF1Q9UMS5 762 aa5.07□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 TRPM2O94759 1503 aa5.07□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 ABCC1P33527 1531 aa5.07□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 ARAP3Q8WWN8 1544 aa5.07□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 ABCC2Q92887 1545 aa5.07□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 MYO5CQ9NQX4 1742 aa5.06□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa5.06□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa5.06□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 TNFRSF6BO95407 300 aa5.06□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 CKMT1AP12532 417 aa5.06□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 PEX5P50542 639 aa5.06□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 SPARCL1Q14515 664 aa5.06□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 RPS6KA2Q15349 733 aa5.06□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 GALNT7Q86SF2 657 aa5.06□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 EXOC3L1Q86VI1 746 aa5.06□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 TMC8Q8IU68 726 aa5.06□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 RBFAQ8N0V3 343 aa5.06□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 CPT1BQ92523 772 aa5.06□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 WBP2Q969T9 261 aa5.06□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 IL17FQ96PD4 163 aa5.06□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 EPYCQ99645 322 aa5.06□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 GAREM1Q9H706 876 aa5.06□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa5.06□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP5.06□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 NOTCH3Q9UM47 2321 aa5.06□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 PIK3C2GO75747 1445 aa5.06□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 SCAPERQ9BY12 1400 aa5.06□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa5.05□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 DEPDC5O75140 1603 aa5.05□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 VWDEQ8N2E2 1590 aa5.05□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 A0A0U1RQJ8 604 aa5.05□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 PLEKHD1A6NEE1 506 aa5.05□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 PRR23AA6NEV1 266 aa5.05□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 SYN3O14994 580 aa5.05□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 ITGA2BP08514 1039 aa5.05□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 CYP4B1P13584 511 aa5.05□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 GYS1P13807 737 aa5.05□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 DEKP35659 375 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 DPP6P42658 865 aa5.05□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 TECP42680 631 aa5.05□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 BTKQ06187 659 aa5.05□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 MYBPHQ13203 477 aa5.05□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 GALNTL6Q49A17 601 aa5.05□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 KSR2Q6VAB6 950 aa5.05□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 TRIM74Q86UV6 250 aa5.05□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 TRIM73Q86UV7 250 aa5.05□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 OR1N1Q8NGS0 311 aa5.05□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 TMEM41AQ96HV5 264 aa5.05□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 TNIP3Q96KP6 325 aa5.05□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 SGCZQ96LD1 299 aa5.05□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 TESK2Q96S53 571 aa5.05□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 SDF2L1Q9HCN8 221 aa5.05□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 UPB1Q9UBR1 384 aa5.05□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 MALT1Q9UDY8 824 aa5.05□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 DAPP1Q9UN19 280 aa5.05□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa5.05□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 WDR7Q9Y4E6 1490 aa5.05□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 DISP3Q9P2K9 1392 aa5.04□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 ARHGAP5Q13017 1502 aa5.04□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa5.04□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 A0A1B0GVM2 712 aa5.04□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 DYTNA2CJ06 578 aa5.04□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 TSPY4P0CV99 314 aa5.04□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 TSPY10P0CW01 314 aa5.04□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 LYL1P12980 280 aa5.04□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 RPS6KA3P51812 740 aa5.04□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 PTK2BQ14289 1009 aa5.04□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 TTC22Q5TAA0 569 aa5.04□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa5.04□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 NAGSQ8N159 534 aa5.04□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 SCAIQ8N9R8 606 aa5.04□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa5.04□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 POC1AQ8NBT0 407 aa5.04□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 BICD1Q96G01 975 aa5.04□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 KATNAL1Q9BW62 490 aa5.04□□□□□ -1.6
SGCE-211ENST00000522045 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa5.04□□□□□ -1.6
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