RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510204.5

SH3BP2-217, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 3,617 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-217ENST00000510204 PLD1Q13393 1074 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 FCRLBQ6BAA4 426 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 POTEAQ6S8J7 498 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 C1orf186Q6ZWK4 172 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 PPIL6Q8IXY8 311 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 RCOR2Q8IZ40 523 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 FBXO36Q8NEA4 188 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 HTRA1Q92743 480 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 NT5C1BQ96P26 610 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 MOGAT1Q96PD6 335 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 KCNK16Q96T55 309 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 OLAHQ9NV23 265 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 CDH22Q9UJ99 828 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 SERPINA10Q9UK55 444 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 PSMD13Q9UNM6 376 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 MAPRE3Q9UPY8 281 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 CLRN2A0PK11 232 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 BCL10O95999 233 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 DNAJB1P25685 340 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 CYP2C18P33260 490 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 NOVP48745 357 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 MAPK11Q15759 364 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 OR2T3Q8NH03 318 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 BCL2L14Q9BZR8 327 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 CYP4F11Q9HBI6 524 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 POMPQ9Y244 141 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 SERPINI2O75830 405 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 KCNH1O95259 989 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 IFI30P13284 250 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 MMP8P22894 467 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 SSTP61278 116 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 CHI3L2Q15782 390 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 CCNJQ5T5M9 372 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 LGSNQ5TDP6 509 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 DCUN1D2Q6PH85 259 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 ARMC8Q8IUR7 673 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 TMEM35BQ8NCS4 154 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP11.92□□□□□ -0.57e-7■■□□□ 13.4
SH3BP2-217ENST00000510204 COA1Q9GZY4 146 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 TINAGQ9UJW2 476 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 ITGA11Q9UKX5 1188 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 TCP10L2B9ZVM9 353 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 PTP4A3O75365 173 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 PIAS1O75925 651 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 SNAP29O95721 258 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 SELPLGQ14242 412 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 FBXO11Q86XK2 927 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 TEX47Q8TBZ9 253 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 SPATA18Q8TC71 538 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 SLC2A14Q8TDB8 520 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 SLC10A4Q96EP9 437 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 PKD2L2Q9NZM6 624 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 KCND2Q9NZV8 630 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 LINC00587B1AMM8 73 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 PROCP04070 461 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 GRIA1P42261 906 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 ARFIP1P53367 373 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 TAS2R40P59535 323 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 FAAP100Q0VG06 881 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 PMS2P3Q13401 168 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 Q5BKY6 102 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 ALG1LQ6GMV1 187 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 XXYLT1Q8NBI6 393 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 SVIPQ8NHG7 77 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 CMTM5Q96DZ9 223 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 SERAC1Q96JX3 654 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 ZNF221Q9UK13 617 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 LAMB2P55268 1798 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP11.91□□□□□ -0.54e-12■■■■■ 275.7
SH3BP2-217ENST00000510204 KRT37O76014 449 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 KRT1P04264 644 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 IFNA16P05015 189 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 PIK3R1P27986 724 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 TTKP33981 857 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 SOX9P48436 509 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 UBE3AQ05086 875 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 GABPAQ06546 454 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 RALGPS1Q5JS13 557 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 ERMP1Q7Z2K6 904 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 KBTBD6Q86V97 674 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 THNSL1Q8IYQ7 743 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 ENPP5Q9UJA9 477 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 NAV1Q8NEY1 1877 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP2-217ENST00000510204 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms