RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510074.5

SH3BP2-215, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 649 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-215ENST00000510074 ITGB6P18564 788 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 CXCR3P49682 368 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 BLKP51451 505 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 CCL7P80098 99 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 ELOCQ15369 112 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 KLHL10Q6JEL2 608 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF783Q6ZMS7 281 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 VPS36Q86VN1 386 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 ARL10Q8N8L6 244 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 CENPTQ96BT3 561 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 FAM81BQ96LP2 452 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 SEMA3CQ99985 751 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 CLPBQ9H078 707 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP16.12■□□□□ 0.178e-6■■■□□ 16.7
SH3BP2-215ENST00000510074 STAP1Q9ULZ2 295 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 DAB1O75553 588 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 GNA14O95837 355 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 NTRK1P04629 796 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 ALPIP09923 528 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 HGFP14210 728 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 PPP1R2P41236 205 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 DEUP1Q05D60 604 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 ARHGAP44Q17R89 818 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF805Q5CZA5 627 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 LVRNQ6Q4G3 990 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 OLFML1Q6UWY5 402 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 TTC7BQ86TV6 843 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 LURAP1LQ8IV03 231 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 CCDC74AQ96AQ1 378 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 TM6SF2Q9BZW4 377 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 TMEM51Q9NW97 253 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 ACSL6Q9UKU0 697 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 ITM2BQ9Y287 266 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 COL12A1Q99715 3063 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 D6RAR5 112 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 AGRPO00253 132 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 KRIT1O00522 736 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 TOR1BO14657 336 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 PPFIA2O75334 1257 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 TM7SF2O76062 418 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 ERBB2P04626 1255 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 KRT9P35527 623 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 SULT1E1P49888 294 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 GNA12Q03113 381 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 PTK2Q05397 1052 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 TCEA2Q15560 299 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 TBR1Q16650 682 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 MACC1Q6ZN28 852 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 SLC26A9Q7LBE3 791 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 RD3Q7Z3Z2 195 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 GKN2Q86XP6 184 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 HID1Q8IV36 788 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 PLPP6Q8IY26 295 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF683Q8IZ20 524 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 OR6C4Q8NGE1 309 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 OR6K2Q8NGY2 324 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 NPY6RQ99463 290 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 LRRN3Q9H3W5 708 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 GDPD2Q9HCC8 539 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 ANLNQ9NQW6 1124 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 GGT7Q9UJ14 662 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 GPR34Q9UPC5 381 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 LOXL2Q9Y4K0 774 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 BICDL2A1A5D9 508 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 MMP20O60882 483 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 ZMPSTE24O75844 475 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 POP4O95707 220 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 GKP32189 559 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 CCKBRP32239 447 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 ABL2P42684 1182 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 ARF5P84085 180 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 TRIM59Q8IWR1 403 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 DRC7Q8IY82 874 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 PCDH19Q8TAB3 1148 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 SPATA20Q8TB22 786 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 CXorf40AQ8TE69 158 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 TMEM159Q96B96 161 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 ZYG11BQ9C0D3 744 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 SLC25A18Q9H1K4 315 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 RABGEF1Q9UJ41 708 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP2-215ENST00000510074 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms