RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 VAPBO95292 243 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 F7P08709 466 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 PPP3CCP48454 512 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ARFIP2P53365 341 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 IRX4P78413 519 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 CDK18Q07002 472 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 STX3Q13277 289 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 CNGA3Q16281 694 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 RABGAP1LQ5R372 815 aa8.29□□□□□ -1.08
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PDE4D-208ENST00000502484 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 PACS2Q86VP3 889 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 CFAP52Q8N1V2 620 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
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PDE4D-208ENST00000502484 COPG2Q9UBF2 871 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 H3BNC9 293 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ATP5HO75947 161 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 AHSGP02765 367 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 KLKB1P03952 638 aa8.28□□□□□ -1.08
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PDE4D-208ENST00000502484 C2P06681 752 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 GABRB3P28472 473 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ABCG1P45844 678 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 POLD2P49005 469 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 GNA12Q03113 381 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 GRM3Q14832 879 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 VEPH1Q14D04 833 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ALG1LQ6GMV1 187 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 KDELC2Q7Z4H8 507 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 DENND1CQ8IV53 801 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 SLC25A41Q8N5S1 370 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 C20orf27Q9GZN8 174 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 CAB39LQ9H9S4 337 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 TXLNGQ9NUQ3 528 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 SPG21Q9NZD8 308 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ZFP69BQ9UJL9 534 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 INSL6Q9Y581 213 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 A0A0D9SEW6 157 aa8.28□□□□□ -1.08
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PDE4D-208ENST00000502484 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 DNAJC6O75061 913 aa8.28□□□□□ -1.08
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PDE4D-208ENST00000502484 ETFBP38117 255 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 PLD1Q13393 1074 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF235Q14590 738 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 DLG2Q15700 870 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 TAF12Q16514 161 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 TSTD2Q5T7W7 516 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 CHST9Q7L1S5 443 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 CLNKQ7Z7G1 428 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 LCA5Q86VQ0 697 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 CRLF3Q8IUI8 442 aa8.28□□□□□ -1.08
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PDE4D-208ENST00000502484 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ACVR1CQ8NER5 493 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 SKA1Q96BD8 255 aa8.28□□□□□ -1.08
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PDE4D-208ENST00000502484 FAM167BQ9BTA0 163 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
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PDE4D-208ENST00000502484 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 C2orf78A6NCI8 922 aa8.27□□□□□ -1.09
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PDE4D-208ENST00000502484 MUSKO15146 869 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 SERPINE1P05121 402 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 MYL2P10916 166 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 NQO1P15559 274 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
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