RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491592.1

RTN4-215, Transcript of reticulon 4, human

TSL 2

Gene RTN4, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RTN4-215	ENST00000491592		A0A087WWL8	130 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592		E7ENX8	843 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592		H3BQV1	296 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	CYR61	O00622	381 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	VILL	O15195	856 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	LPXN	O60711	386 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	PRAMEF10	O60809	474 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	SMPD2	O60906	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	TBX10	O75333	385 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	SLITRK3	O94933	977 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	CSPG5	O95196	566 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	SMC2	O95347	1197 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	CSF1	P09603	554 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	PDHB	P11177	359 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	TACR2	P21452	398 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	FDXR	P22570	491 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	ADSS	P30520	456 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	CENPA	P49450	140 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	CCR5	P51681	352 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	UCP3	P55916	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	GMFB	P60983	142 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	TAP2	Q03519	686 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	GBE1	Q04446	702 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	ST3GAL1	Q11201	340 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	CETN1	Q12798	172 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	KIF5A	Q12840	1032 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	SNX1	Q13596	522 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	RAB32	Q13637	225 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	MAJIN	Q3KP22	176 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	BOLA3	Q53S33	107 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	WDR93	Q6P2C0	686 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	SESTD1	Q86VW0	696 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	ADSSL1	Q8N142	457 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	SPERT	Q8NA61	448 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	SPATA20	Q8TB22	786 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	AFG1L	Q8WV93	481 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	SMARCE1	Q969G3	411 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	NRBF2	Q96F24	287 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	EPSTI1	Q96J88	318 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	ZNF747	Q9BV97	191 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	FUT8	Q9BYC5	575 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	KRT23	Q9C075	422 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	USP44	Q9H0E7	712 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	DKK2	Q9UBU2	259 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	USP16	Q9Y5T5	823 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	AKAP12	Q02952	1782 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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