RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 SHBQ15464 509 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 HLFQ16534 295 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 TANGO2Q6ICL3 276 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC174Q6PII3 467 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 CLEC4GQ6UXB4 293 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 SPICE1Q8N0Z3 855 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 KRT222Q8N1A0 295 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 GALNT15Q8N3T1 639 aa4.48□□□□□ -1.69
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RABGGTB-210ENST00000485459 LMLNQ96KR4 655 aa4.48□□□□□ -1.69
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RABGGTB-210ENST00000485459 TAGLN3Q9UI15 199 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 KIF15Q9NS87 1388 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 MST1RQ04912 1400 aa4.47□□□□□ -1.69
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RABGGTB-210ENST00000485459 METTL18O95568 372 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 IGHDP01880 384 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 NAGAP17050 411 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 THPOP40225 353 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP4.47□□□□□ -1.695e-8■■□□□ 13.8
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RABGGTB-210ENST00000485459 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 HNF4GQ14541 408 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 AP5B1Q2VPB7 878 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF284Q2VY69 593 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 ATG9BQ674R7 924 aa4.47□□□□□ -1.69
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RABGGTB-210ENST00000485459 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 CREB3L2Q70SY1 520 aa4.47□□□□□ -1.69
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RABGGTB-210ENST00000485459 SAMD3Q8N6K7 520 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 G6PC2Q9NQR9 355 aa4.47□□□□□ -1.69
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RABGGTB-210ENST00000485459 IL36RNQ9UBH0 155 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 TIAM1Q13009 1591 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 ERCC6L2Q5T890 1561 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 KIF16BQ96L93 1317 aa4.46□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa4.46□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa4.46□□□□□ -1.69
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RABGGTB-210ENST00000485459 INSRP06213 1382 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa4.46□□□□□ -1.7
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RABGGTB-210ENST00000485459 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 REC8O95072 547 aa4.46□□□□□ -1.7
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RABGGTB-210ENST00000485459 IL1AP01583 271 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 CSF1P09603 554 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 ARSAP15289 507 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 YWHAQP27348 245 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 CASQ1P31415 396 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 CHKAP35790 457 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 TDO2P48775 406 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 GAS1P54826 345 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 ARHGAP8P85298 464 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 CUL4BQ13620 913 aa4.46□□□□□ -1.7
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RABGGTB-210ENST00000485459 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
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RABGGTB-210ENST00000485459 IL13RA2Q14627 380 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 NCAPH2Q6IBW4 605 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 NR2C2APQ86WQ0 139 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 KIF18AQ8NI77 898 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 SNX21Q969T3 373 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 CHODLQ9H9P2 273 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 DONSONQ9NYP3 566 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 STK26Q9P289 416 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 TOPBP1Q92547 1522 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 A0A096LPK6 155 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 OR6C68A6NDL8 312 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 CREB3O43889 395 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 KCNJ13O60928 360 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-210ENST00000485459 FCGR1AP12314 374 aa4.45□□□□□ -1.7
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