RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 CXorf40AQ8TE69 158 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 ASB12Q8WXK4 309 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 RFFLQ8WZ73 363 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 BAP1Q92560 729 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 CNPY3Q9BT09 278 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 MAGEB5Q9BZ81 275 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 TTYH3Q9C0H2 523 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 USP29Q9HBJ7 922 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 FAM208BQ5VWN6 2430 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 A0A087WV48 116 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 LRRC10BA6NIK2 292 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 SCAMP1O15126 338 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 TMCC1O94876 653 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 CKMT1AP12532 417 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 ABL2P42684 1182 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 ABCG1P45844 678 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 FGL2Q14314 439 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 PARP15Q460N3 678 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 CFAP58Q5T655 872 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 ACAD10Q6JQN1 1059 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 KDM7AQ6ZMT4 941 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 PYROXD2Q8N2H3 581 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 BTN2A2Q8WVV5 523 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 APOLD1Q96LR9 279 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
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ACTB-212ENST00000484841 RAD51BO15315 384 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 RASA4O43374 803 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 TM7SF2O76062 418 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 MT-CO3P00414 261 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 CSF2P04141 144 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 JUNDP17535 347 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 TPI1P60174 286 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 FZD2Q14332 565 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 RTP5Q14D33 572 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 CCDC183Q5T5S1 534 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 FZD10Q9ULW2 581 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 ITM2BQ9Y287 266 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 ASPMQ8IZT6 3477 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 K7ESM1 405 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 NME1P15531 152 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 ACTN2P35609 894 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 GRM3Q14832 879 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 FILIP1LQ4L180 1135 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 VPS36Q86VN1 386 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 MCOLN2Q8IZK6 566 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 AOPEPQ8N6M6 819 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 PAF1Q8N7H5 531 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 HMCESQ96FZ2 354 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 DEPDC7Q96QD5 511 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 IL12RB2Q99665 862 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 SPASTQ9UBP0 616 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 GGT7Q9UJ14 662 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 NEU3Q9UQ49 428 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 ZFHX4Q86UP3 3567 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 TMCO5BA8MYB1 307 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 DAPK3O43293 454 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 NEBLO76041 1014 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 GP1BAP07359 652 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 HTR7P34969 479 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 ELP6Q0PNE2 266 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 SERINC3Q13530 473 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 FAM181AQ8N9Y4 354 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 LMX1AQ8TE12 382 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 GLMNQ92990 594 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 VCPIP1Q96JH7 1222 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 GPR27Q9NS67 375 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 PARVAQ9NVD7 372 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 CHD6Q8TD26 2715 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 WASH4PA8MWX3 477 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 AQP9O43315 295 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 OPA1O60313 960 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 MMP20O60882 483 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 RNF8O76064 485 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 PSMA2P25787 234 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 SUOXP51687 545 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 PFN3P60673 137 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 YPEL5P62699 121 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 LRRC73Q5JTD7 316 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 DNAAF5Q86Y56 855 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 MAPK15Q8TD08 544 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 FGF11Q92914 225 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-212ENST00000484841 SLC13A1Q9BZW2 595 aa20.4■□□□□ 0.86
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