RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM248Q9NWD8 314 aa8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 LRRK1Q38SD2 2015 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 NBEAQ8NFP9 2946 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 CPED1A4D0V7 1026 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 NEMP2A6NFY4 417 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 A8MX80 341 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 RAD51BO15315 384 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 PRPSAP2O60256 369 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 PIGNO95427 931 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 FTLP02792 175 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 ALPPL2P10696 532 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 CKMT2P17540 419 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 DGKAP23743 735 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 ABL2P42684 1182 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF165P49910 485 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 TPM4P67936 248 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 PTP4A2Q12974 167 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 NCAPHQ15003 741 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 NFKBIBQ15653 356 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 COL28A1Q2UY09 1125 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 FAXCQ5TGI0 409 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 FOXR1Q6PIV2 292 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 CRTC1Q6UUV9 634 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 GCNT7Q6ZNI0 430 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 RD3Q7Z3Z2 195 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 IQCHQ86VS3 1027 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 NLRP14Q86W24 1093 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 TMPRSS12Q86WS5 348 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 LMX1AQ8TE12 382 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 NTAN1Q96AB6 310 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF653Q96CK0 615 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 KLC2Q9H0B6 622 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 SP110Q9HB58 689 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 PARVAQ9NVD7 372 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 KLHL11Q9NVR0 708 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF212Q9UDV6 495 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 FZD10Q9ULW2 581 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 AP4E1Q9UPM8 1137 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 DOLKQ9UPQ8 538 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 COQ6Q9Y2Z9 468 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 FADS3Q9Y5Q0 445 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 FREM2Q5SZK8 3169 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 ACACAQ13085 2346 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 SYCE3A1L190 88 aa8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 FAM221BA6H8Z2 402 aa8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 ARHGAP42A6NI28 874 aa8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 H3BM21 787 aa8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 J3KR12 359 aa8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 AGRPO00253 132 aa8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 INSIG1O15503 277 aa8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 TSPAN6O43657 245 aa8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 PALMO75781 387 aa8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 PIAS2O75928 621 aa8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 TM7SF2O76062 418 aa8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 CD160O95971 181 aa8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 GSRP00390 522 aa8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 PRKCGP05129 697 aa8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 C7P10643 843 aa8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 JUNDP17535 347 aa8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 GJC1P36383 396 aa8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 RXRGP48443 463 aa8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 ACADVLP49748 655 aa8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 OGDHQ02218 1023 aa8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 C1orf61Q13536 156 aa8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 FGL2Q14314 439 aa8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 CDKN3Q16667 212 aa8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 CA9Q16790 459 aa8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 DEFB133Q30KQ1 61 aa8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 MANEALQ5VSG8 457 aa8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 BNIPLQ7Z465 357 aa8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 SLC25A45Q8N413 288 aa8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM145Q8NBT3 493 aa8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 HSPH1Q92598 858 aa8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 ARHGEF26Q96DR7 871 aa8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 BMFQ96LC9 184 aa8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 IL12RB2Q99665 862 aa8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa8.18□□□□□ -1.1
CTPS1-209ENST00000480420 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa8.18□□□□□ -1.1
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