RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473542.1

BBX-223, Transcript of BBX, HMG-box containing, human

TSL 3

Gene BBX, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBX-223	ENST00000473542	HOXD13	P35453	343 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	OLR1	P78380	273 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	SLC18A2	Q05940	514 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	KCTD2	Q14681	263 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	SYTL3	Q4VX76	610 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	MIDN	Q504T8	468 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	ZNF425	Q6IV72	752 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	DPP10	Q8N608	796 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	DPF1	Q92782	380 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	GHITM	Q9H3K2	345 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	EHD2	Q9NZN4	543 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542		A0A096LPK6	155 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542		A0A0A0MQY5	61 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542		A6NCN8	305 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	LIPT2	A6NK58	231 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	LRRC53	A6NM62	1247 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	BCAR3	O75815	825 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	PCNA	P12004	261 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	SLC2A4	P14672	509 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	DPP6	P42658	865 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	CPA2	P48052	419 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	SARM1	Q6SZW1	724 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	SERPINA11	Q86U17	422 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	TRIM74	Q86UV6	250 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	TRIM73	Q86UV7	250 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	CCDC89	Q8N998	374 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	ZNF333	Q96JL9	665 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	SDF4	Q9BRK5	362 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	VPS28	Q9UK41	221 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	UGDH	O60701	494 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	PAGE4	O60829	102 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	MMP3	P08254	477 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	MAPK4	P31152	587 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	RYK	P34925	604 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	PSMB10	P40306	273 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	EFNA5	P52803	228 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	ID2	Q02363	134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	CUL4A	Q13619	759 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	ACVR2B	Q13705	512 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	CEP78	Q5JTW2	689 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	MOB3C	Q70IA8	216 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	CNTROB	Q8N137	903 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	BICD2	Q8TD16	824 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	SMARCE1	Q969G3	411 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	UTY	O14607	1347 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
BBX-223	ENST00000473542	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	TP73	O15350	636 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	TIMM44	O43615	452 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	TLR2	O60603	784 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	TSPAN9	O75954	239 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	TF	P02787	698 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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