RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471538.1

SPEN-204, Transcript of spen family transcriptional repressor, humanhuman

TSL 2

Gene SPEN, Length 1,404 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEN-204ENST00000471538 TCAF1Q9Y4C2 921 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 COL4A6Q14031 1691 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 A0A096LPK6 155 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 TARM1B6A8C7 271 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 GSC2O15499 205 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 CCDC22O60826 627 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 TADA2AO75478 443 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 CNTN5O94779 1100 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 SERPINA6P08185 405 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 MMP2P08253 660 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 SBK3P0C264 359 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 SLC2A3P11169 496 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 CPA3P15088 417 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 ABCG1P45844 678 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 SLC11A1P49279 550 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 GATMP50440 423 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 CCNG1P51959 295 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 IRX4P78413 519 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 GPR17Q13304 367 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 ANO4Q32M45 955 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 CTXN3Q4LDR2 81 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 ALFQ53S48 1182 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 WASHC2DQ5SRD0 308 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 RASIP1Q5U651 963 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 C1orf53Q5VUE5 145 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 ZNF280DQ6N043 979 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 RINLQ6ZS11 566 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 CCDC91Q7Z6B0 441 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 LCA5Q86VQ0 697 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 MFSD6LQ8IWD5 586 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 FAM126BQ8IXS8 530 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 ATAD1Q8NBU5 361 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 IPMKQ8NFU5 416 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 MYLIPQ8WY64 445 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 HMCESQ96FZ2 354 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 RANBP9Q96S59 729 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 EBF4Q9BQW3 602 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 BTBD10Q9BSF8 475 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 ZYG11BQ9C0D3 744 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 SLC25A51Q9H1U9 297 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 DNAJC28Q9NX36 388 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 TAS2R1Q9NYW7 299 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 ARMCX1Q9P291 453 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 CHD7Q9P2D1 2997 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 CHD5Q8TDI0 1954 aa6.49□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 TMEM114B3SHH9 223 aa6.49□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 GOLGA8TH3BQL2 631 aa6.49□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 J3KR12 359 aa6.49□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 SOAT2O75908 522 aa6.49□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 TBX18O95935 607 aa6.49□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 AHSGP02765 367 aa6.49□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 SLC35E2BP0CK96 405 aa6.49□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 KITP10721 976 aa6.49□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 RALBP11234 206 aa6.49□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 COL6A2P12110 1019 aa6.49□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 GNAZP19086 355 aa6.49□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 AOC1P19801 751 aa6.49□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 YWHAQP27348 245 aa6.49□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 CHRNA4P43681 627 aa6.49□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 POLD2P49005 469 aa6.49□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 NUMBP49757 651 aa6.49□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 IDH3AP50213 366 aa6.49□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 WNT3AP56704 352 aa6.49□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 MPP1Q00013 466 aa6.49□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 ZBTB16Q05516 673 aa6.49□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 RING1Q06587 406 aa6.49□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 EFEMP1Q12805 493 aa6.49□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 SMARCB1Q12824 385 aa6.49□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 TAF10Q12962 218 aa6.49□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 ITGA9Q13797 1035 aa6.49□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 POU6F1Q14863 301 aa6.49□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 TBCCQ15814 346 aa6.49□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 PSMD5Q16401 504 aa6.49□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 C5orf22Q49AR2 442 aa6.49□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 RTP2Q5QGT7 225 aa6.49□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 C9orf50Q5SZB4 431 aa6.49□□□□□ -1.37
SPEN-204ENST00000471538 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms